ミリガン・カレッジはテネシー州東部のカーター郡に位置しています。 その起源は、小さなキリスト教（キリストの弟子たち）の集会によってチャーターされたバッファロー男性および女性研究所（1866年）にさかのぼります。 1882年にジョセフス・ホップウッドが、ケンタッキー大学の尊敬する教授の名を冠したカレッジに格上げしました。
1917年、新しい時代が始まりました。 新学長のヘンリー・J・ダーシックは、「丘の上の羊飼い」として愛され、4つの主要な建物を完成させました。第二次世界大戦中、大学はすべての施設を海軍のV-12プログラムに転換し、近隣の山岳地帯の若者たちのために競争力のある教養大学を創設し、生き残ったのです。 戦後の一時的な好景気は、あっという間に災難に見舞われることになった。
近代は、1950年の暗黒の時代に始まりました。
近代的な時代は1950年の暗黒時代から始まり、バトラー大学からディーン・E・ウォーカーが新学長としてやってきました。 彼は、ミリガンを弟子運動の中の保守的で独立した派閥（キリスト教会とキリストの教会）と連携させました。 このことは、同情的な個人や集会からの財政的支援の増加につながった。 地域性が薄く、増え続ける学生（1995-96年、866名）は、この交わりを代表するようになった。
ミリガンは、財政的に安定し、キャンパスが大幅に拡張されたため、1960年に地域の認定を取り戻しました。
2000-2001年度には、900人以上の学生がミリガンに在籍し、29の専攻分野を提供しています。
2000-2001年度には、900人以上の学生が在籍し、29の専攻科目を提供しています。1997年には、同校の卒業生であるドナルド R. ジーンズが14代目の学長に就任しました。