殺菌剤は抗真菌剤とも呼ばれ、真菌を殺したり、成長を抑制するために使われるあらゆる毒性物質である。 殺菌剤は一般的に、作物や観賞植物に経済的な損害を与えるか、家畜や人間の健康を危険にさらす寄生真菌を制御するために使用されています。 農園芸用殺菌剤の多くは、散布剤または粉剤として使用されます。 種子用殺菌剤は、発芽前の保護カバーとして散布されます。 全身用殺菌剤（化学療法剤）は、植物に散布され、組織全体に分布し、既存の病気を根絶するため、または起こりうる病気から保護するために作用します。
Jeff Kubina
ボルドー液は、水和石灰、硫酸銅、水から成る液体で、初期の殺菌剤のひとつでした。 ボルドー液とブルゴーニュ液は、今でも果樹園の樹木に広く使用されています。 銅化合物と硫黄は別々に、あるいは組み合わせて植物に使用されており、一部は有機農法に適していると考えられている。 その他の有機殺菌剤としては、ニーム油、園芸用油、重炭酸塩などがある。
塩化カドミウムやコハク酸カドミウムは、芝草の病害防除に使用されています。 塩化水銀（II）、または腐食性昇華物は、球根や塊茎を処理するための浸漬剤として使用されることがありますが、人間に対して非常に有毒です。 ストロビルリン系化合物は、工業用農業において、さまざまな種類のベト病、カビ、サビを殺すために使用されている。 その他、クロルピクリン、臭化メチル、ホルムアルデヒドなども殺菌に使われることがあるが、これらの殺菌剤の使用は多くの国で規制されているか禁止されている。 抗真菌物質の多くは、植物組織中に自然に存在する。
殺菌剤は、病原性または寄生性の真菌の重要な細胞プロセスを破壊することによって、その菌を殺します。 例えば、多くの殺菌剤は特定の酵素と結合して、細胞呼吸に関わる代謝経路を妨害します。 しかし、除草剤、殺虫剤、抗生物質と同様に、殺菌剤の過剰使用は、ある種の真菌の耐性進化につながった。
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