線条体（主に背側線条体）は基底核の主要な入力領域の一つである。 大脳皮質からの入力線維が大部分であるが、黒質、視床からの求心線維も受ける。 大脳皮質からの線維（すなわち皮質脊髄線維）は、しばしば運動計画に関する情報を運び、その計画は修正されて大脳皮質に送り返され、実行に移される。 しかし、大脳皮質から線条体に向かう線維は運動に関するものだけではないことに注意しなければならない。 線条体は大脳皮質機能の多くの側面（ひいては認知の多くの側面）に関与していると考えられており、運動野だけでなく大脳皮質全域の領域から入力を受けているのです。 黒質からの求心性神経は、黒質経路と総称され、パーキンソン病の患者では神経変性により深刻な影響を受けるため、運動において特に重要な役割を果たすと思われる。
線条体を出た線維は、ほとんどが基底核の主な出力核である淡蒼球と黒質に向かいます。
腹側線条体には側坐核があり、報酬体験における役割について広く研究されている核である。 側坐核、および腹側線条体全体は、報酬、強化、および報酬的な何かを経験するだけから依存症の一部として強迫的にそれを求めるようになることに関連している。
腹側線条体への求心性投射は、背側線条体のものとほぼ同じ場所から来ます (腹側線条体は扁桃体や海馬からより多くの入力を得るようですが)。 しかし、報酬に対する腹側線条体の関与は、中脳のドーパミンが豊富な腹側被蓋野（VTA）から側坐核に向かう線維に最も多く関連している。 このVTAから側坐核に至る経路は、中脳辺縁系ドーパミン経路と呼ばれています。
このように、線条体は運動と報酬体験の仲介に最もよく関連しているのです。 しかし、前述したように線条体は認知や行動の様々な側面に関与していると考えられている。 つまり、運動、報酬、動機付けは線条体に関連する機能の中で最も研究されているかもしれませんが、決してその範囲ではありません
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