診断は、患者の性病歴と、肉芽組織の特徴的な巻き縁を持つ無痛の「牛皮色潰瘍」を示す身体検査に基づいて行われます。 梅毒性潰瘍とは対照的に，鼠径リンパ節腫脹は一般に軽度か消失する。 診断には組織生検とWright-Giemsa染色が用いられる。 組織検体中にドノバン小体があればドノバン症であることが確認できます。
ドノバン小体は棒状の楕円形の生物で、鼠径部肉芽腫患者の組織サンプル中の単核食細胞または組織球の細胞質で見ることができ、ライト染色で染色すると濃い紫色に見えます。 この細胞内封入体は、原因菌のグラム陰性桿菌が封入されたものである。
分類
この疾患の最初の既知の名前は「蛇紋岩性潰瘍」で、1882 年に付けられました。 ドノバン症に対する適切な臨床的呼称は「鼠径部肉芽腫」です。 肉芽腫は結節型の炎症反応であり、鼠径部とはこの感染症によく見られる鼠径部のことである。
原因菌のKlebsiella granulomatisはCalymmatobacterium granulomatisと呼ばれていましたが、現在でも一部の資料では、菌を含む病変を指してギリシャ語のkalymma（フードまたはベール）からこの分類を使用しています。
グラニュロマティスという名称は、肉芽腫性病変に由来しており、それ以前はドノバニア・グラニュロマティスと呼ばれていました。 この菌は最近Klebsiella属に再分類されたが、これは菌の門を変更することになるので、分類学上の大幅な変更である。 しかし，比色検出系を用いたポリメラーゼ連鎖反応法では，Klebsiella属の他種との類似性は99％であった。 この病変の口腔内での臨床的外観は、3つのタイプに分類される。 潰瘍性，滲出性，瘢痕性である。