A doença é geralmente fatal 3; entre os casos bem documentados, há apenas cinco sobreviventes conhecidos na América do Norte: um dos EUA em 1978 5, um do México em 2003 6, dois dos EUA em 2013 4, 7, 8, e um dos EUA em 2016. A condição original do sobrevivente americano melhorou gradualmente durante uma hospitalização de um mês. O único efeito colateral relatado ao tratamento foi uma redução na sensação da perna durante dois meses após a alta, que gradualmente melhorou. Também não houve detecção de Naegleria fowleri 3 dias após o tratamento 5. Foi sugerido que a estirpe original de Naegleria fowleri, sobrevivente do tratamento, pode ter sido menos virulenta, o que contribuiu para a recuperação do paciente. Em experiências de laboratório, a estirpe sobrevivente da Califórnia não causou danos às células tão rapidamente como outras estirpes, sugerindo que é menos virulenta do que as estirpes recuperadas de outros casos fatais 9,
A condição do sobrevivente do México só começou a melhorar 40 horas após a admissão no hospital. No dia 22 da internação, não houve nenhuma anormalidade mostrada no exame cerebral e o paciente teve alta no dia seguinte. O paciente foi acompanhado durante os 12 meses seguintes sem nenhuma recorrência da doença 6,
Após 35 anos sem um sobrevivente de Naegleria nos Estados Unidos, durante o verão de 2013, duas crianças com infecção de Naegleria fowleri sobreviveram. A primeira, uma menina de 12 anos de idade, foi diagnosticada com PAM aproximadamente 30 horas após adoecer e foi iniciada com o tratamento recomendado em 36 horas. Ela também recebeu o medicamento de investigação miltefosina, e seu inchaço cerebral foi agressivamente controlado com tratamentos que incluíram hipotermia terapêutica (resfriamento do corpo abaixo da temperatura corporal normal). Esta paciente fez uma recuperação neurológica completa e voltou para a escola. Sua recuperação foi atribuída ao diagnóstico e tratamento precoce e a uma nova terapêutica, incluindo miltefosina e hipotermia 7.
A segunda, de 8 anos de idade, também é considerada uma sobrevivente do PAM, embora tenha sofrido o que é provável que seja um dano cerebral permanente. Ele também foi tratado com miltefosina, mas foi diagnosticado e tratado vários dias depois de seus sintomas começarem. A hipotermia terapêutica não foi usada neste caso 8.
No verão de 2016, um menino de 16 anos foi relatado como o 4º sobrevivente do PAM nos EUA. Este paciente foi diagnosticado poucas horas após sua apresentação ao hospital e foi tratado com o mesmo protocolo utilizado para o sobrevivente de 12 anos de idade de 2013. Este paciente também fez uma recuperação neurológica completa e voltou à escola.
Overall, a perspectiva para as pessoas que contraem esta doença é fraca, embora o diagnóstico precoce e novos tratamentos possam aumentar as chances de sobrevivência.