Como resultado deste processo evolutivo, L. reuteri contribui para a saúde humana ao longo da vida. Os seres humanos nascem quase estéreis e encontram L. reuteri pela primeira vez durante o processo de nascimento e através da amamentação. Como membro fundamental da microbiota intestinal, L. reuteri desempenha um papel importante na digestão do leite materno e dos alimentos sólidos. Ao longo da vida, as bactérias apertam o revestimento do intestino para evitar fugas e melhorar a resposta imunológica. Também liberam moléculas que promovem uma microbiota saudável e diversificada e previnem o crescimento de patógenos. Apoiar a microbiota intestinal é especialmente importante mais tarde na vida, porque os indivíduos idosos tendem a perder diversidade em suas entranhas.
algumas pessoas ainda hoje têm L. reuteri como parte de sua microbiota, mas muitas pessoas não têm essas linhagens como resultado de nossos estilos de vida modernos. Uma dieta pobre em fibras, o aumento do saneamento, o uso de antibióticos e o aumento das taxas de nascimento por cesariana, que não expõem os bebês à bactéria, têm desempenhado um papel no esgotamento de L. reuteri do nosso trato gastrointestinal (IG).
As pessoas podem reintroduzir L. reuteri através do uso de probióticos, mas eles devem ser reabastecidos com freqüência, uma vez que as bactérias são continuamente lavadas do trato IG.