Das Bardavon wurde von dem prominenten Poughkeepsie-Architekten J. A. Wood entworfen und von James S. Post gebaut. Letzterer ist bekannt für den Entwurf oder die Errichtung architektonischer Strukturen im zentralen Geschäftsviertel von Poughkeepsie und im Vassar College. Eine umfassende Renovierung wurde 1905 unter der Leitung des Architekten William Beardsley durchgeführt, der auch das Gerichtsgebäude von Dutchess County und das Staatsgefängnis von Attica entworfen hatte. Das Theater wurde erst am 1. Januar 1923 unter dem neuen Namen The Bardavon Theater wiedereröffnet.
Zu diesem Zeitpunkt wurde es von Paramount gekauft und 1928 mit einer Wurlitzer-Pfeifenorgel ausgestattet. Diese Orgel wurde Mitte der 60er Jahre entfernt und in einem Privathaus in Scarsdale, NY, installiert, bis sie später von einem privaten Sammler abgebaut und eingelagert wurde. Höchstwahrscheinlich ist es das Theater, in dem der Kultfilmregisseur Edward D. Wood, Jr. in seiner Jugend als Platzanweiser diente, obwohl das Bardavon in den Quellen nicht oft namentlich genannt wird. Im Jahr 1947 wurde das Kino weiter modernisiert und mit einem Filmzelt ausgestattet. Der Stil der Inneneinrichtung nach der Renovierung wird als neoklassizistisch beschrieben.
Das Kino wurde bis 1975 weiterbetrieben, als es wegen der massiven Umgestaltung des Stadtzentrums vom Abriss bedroht war. Es befand sich in unmittelbarer Nähe des neuen Civic Center und eines geplanten Autobahnprojekts. Es gab Pläne, das Gebäude abzureißen und das Gelände für einen Parkplatz zu nutzen. Besorgte Bürger taten sich zusammen, um das Theater zu retten, und erreichten, dass es am 20. August 1977 in das National Register of Historic Places aufgenommen und in The Bardavon 1869 Opera House umbenannt wurde. Seitdem wurden mehr als 5 Millionen Dollar gesammelt und für die Teilrenovierung des Bardavon verwendet, das nun wieder als Veranstaltungsort für ein breites Spektrum an darstellenden Künsten wie Theater, Tanz, Musik, Oper und andere Genres genutzt wird. Die originale Wurlitzer-Pfeifenorgel wurde 1983 von der New York Theatre Organ Society (www.nytos.org) entdeckt, und es wurde eine Vereinbarung über die Renovierung und Wiederaufstellung des Instruments getroffen, wobei die NYTOS als ständiger Kurator das Eigentum an dem Instrument behält.
Das Bardavon ist seit über 40 Jahren die Heimat der Hudson Valley Philharmonic. Bei einer bemerkenswerten Aufführung im Jahr 1953 übernahm die ehemalige First Lady Eleanor Roosevelt die Moderation von Prokofjews „Peter und der Wolf“.
Am 30. August 2020 bietet das Bardavon 1869 Opera House eine kostenlose Online-Serie mit dem Titel „Albums Revisited“ an.