Der Erzähler stellt Aylmer als einen brillanten Wissenschaftler und Naturphilosophen vor, der seine Experimente eine Zeit lang aufgegeben hat, um die schöne Georgiana zu heiraten. Eines Tages fragt Aylmer seine Frau, ob sie jemals daran gedacht habe, das Muttermal auf ihrer Wange zu entfernen. Sie verneint fröhlich, wird aber ernst, als sie sieht, dass er die Frage ernsthaft gestellt hat. Viele Leute, sagt sie, hätten ihr gesagt, das Mal sei ein Talisman, und sie habe immer gedacht, dass sie vielleicht Recht hätten. Aylmer meint, da ihr Gesicht fast perfekt sei, sei jedes Mal ein Schock. Georgiana ist zuerst wütend, dann weint sie und fragt, wie er sie lieben könne, wenn sie für ihn schockierend sei.
Der Erzähler erklärt, dass es sich bei dem fraglichen Muttermal um einen roten Fleck in Form einer kleinen Hand auf Georgianas linker Wange handelt. Das Mal verschwindet, wenn sie errötet. Georgianas männliche Verehrer lieben das Muttermal, und viele würden ihr Leben riskieren, nur um es zu küssen. Einige Frauen meinen, das Mal verderbe ihre Schönheit, aber der Erzähler hält das für Unsinn.
Aylmer ist von dem Muttermal besessen. Für ihn symbolisiert es Sterblichkeit und Sünde und überragt in seinen Gedanken Georgianas Schönheit. Er kann an nichts anderes denken. Eines Nachts erinnert sie ihn an einen Traum, den er hatte. Er sprach im Schlaf und sagte, man müsse ihr das Herz herausnehmen. Aylmer erinnert sich an den Traum, in dem er das Muttermal mit einem Messer entfernte und bis zum Herzen seiner Frau vordrang, das er herausschneiden wollte. Georgiana sagt, dass sie ihr Leben riskieren würde, um das Muttermal entfernen zu lassen. Aylmer ist begeistert und willigt ein, es zu versuchen. Er ist von seinen eigenen Fähigkeiten überzeugt und vergleicht sich selbst mit Pygmalion. Er küsst seine Frau auf die unversehrte Wange.
Sie beschließen, in die Wohnungen zu ziehen, in denen Aylmer sein Labor hat. Er hat bereits erstaunliche Entdeckungen über Vulkane, Brunnen, Minen und andere Naturwunder gemacht. Nun wird er seine Studien über die Entstehung des Lebens fortsetzen. Als das Paar das Laboratorium betritt, erschaudert Aylmer beim Anblick von Georgiana, und sie fällt in Ohnmacht. Aminadab, Aylmers grotesker Assistent, kommt heraus, um zu helfen. Er sagt, er würde das Muttermal nicht entfernen, wenn Georgiana seine Frau wäre.
Georgiana wacht in duftenden Räumen auf, die für sie schön gemacht worden sind. Aylmer tröstet sie mit einigen seiner magischen Kreationen: „luftige Figuren, absolut körperlose Ideen und Formen von wesenloser Schönheit“. Er zeigt ihr bewegende Szenen, die das wirkliche Leben imitieren. Dann schenkt er ihr eine schnell wachsende Blume, die stirbt, sobald sie sie berührt. Als nächstes versucht er, mit einer Metallplatte ein Porträt von ihr anzufertigen, aber als die Platte eine Hand zeigt, wirft er sie in Säure.
Zwischen den Experimenten erzählt Aylmer Georgiana von der Alchemie. Er glaubt, dass er unedles Metall in Gold verwandeln und einen Trank herstellen könnte, der ewiges Leben schenken würde, wenn er wollte, obwohl er sagt, dass er weiß, dass dies falsch wäre. Er verschwindet für einige Stunden und zeigt ihr dann seine Wunderkammer. Eines dieser Wunder ist ein Fläschchen, das ein starkes Parfüm enthält. Ein anderes ist ein Gift, mit dem Aylmer, je nach Dosis, jemanden sofort oder nach langer Zeit töten kann. Georgiana ist entsetzt, aber Aylmer sagt, das Gift sei mehr gut als schlecht. Er zeigt ihr einen anderen Trank, der Sommersprossen wegwischen kann, aber er sagt, dass ihr Muttermal eine viel tiefgreifendere Heilung braucht.
Georgiana erkennt, dass Aylmer ihr Essen manipuliert hat oder sie etwas in der Luft einatmen ließ. Ihr Körper fühlt sich seltsam an. Sie liest die Bücher in seiner wissenschaftlichen Bibliothek und auch seine Berichte über seine eigenen Experimente. Sie stellt fest, dass seine Erfolge immer hinter den Zielen zurückbleiben, die er sich ursprünglich gesetzt hat. Dennoch bringen die Berichte über seine Studien sie dazu, ihn zu verehren. Aylmer ertappt sie dabei, wie sie über seinen Tagebüchern weint, und obwohl seine Worte freundlich sind, ist er wütend. Sie singt ihm etwas vor, um ihn wieder aufzumuntern.
Ein paar Stunden später geht Georgiana ins Labor, um Aylmer zu suchen. Als er sie sieht, wird er wütend, wirft ihr vor, neugierig zu sein, und fordert sie auf, wegzugehen. Sie weigert sich und sagt, er solle ihr vertrauen und nicht versuchen, seine Ängste zu verbergen. Sie verspricht ihm, alles zu trinken, was er ihr zu trinken aufträgt. Gerührt sagt Aylmer, dass das Mal tief in ihren Körper eingedrungen ist und seine Entfernung gefährlich sein wird. In ihrem Zimmer denkt Georgiana darüber nach, wie edel es ist, dass Aylmer sich weigert, sie so zu lieben, wie sie ist, und stattdessen darauf besteht, seine ideale Version von ihr zu erschaffen.
Er bringt ihr einen Trank, der, wie er sagt, nicht versagen kann. Er zeigt ihr, wie er eine Geranie von Flecken heilt. Sie trinkt die Flüssigkeit und schläft. Aylmer beobachtet sie mit Zärtlichkeit, aber auch so, als ob er ein wissenschaftliches Experiment beobachten würde. Allmählich verblasst das Muttermal. Aminadab lacht. Georgiana wacht auf, sieht sich im Spiegel und sagt Aylmer, er solle sich nicht schlecht fühlen, weil er „das Beste, was die Erde zu bieten hat“, abgelehnt habe. Dann stirbt sie.