seizoen 2008Edit
Tijdens zijn studie aan de University of Oklahoma speelde Jones van 2008 tot 2012 voor het Oklahoma Sooners footballteam. In 2008 stapte derde quarterback Keith Nichol over naar Michigan State, waardoor senior Joey Halzle en Jones, die zijn eerste jaar redshirt was, overbleven als back-up quarterbacks van Sam Bradford.
2009 seizoenEdit
In 2009, in de seizoensopener tegen Brigham Young, nam Jones het over als de startende quarterback voor de Sooners nadat Bradford een schouderblessure had opgelopen; de Sooners verloren de wedstrijd met een score van 14-13. Echter, in de volgende wedstrijd, zijn eerste als starter, voltooide Jones 18-of-32 passes voor 286 yards, met drie touchdowns en een interception in de 64-0 overwinning van de Sooners tegen Idaho State. In zijn tweede start gooide Jones een Sooner-record van zes touchdown passes met twee interceptions in een 45-0 zege tegen Tulsa. Later die week werd Jones uitgeroepen tot AT&T All- America Player of the Week.
Jones startte de volgende wedstrijd tegen de Miami Hurricanes omdat Sam Bradford nog niet volledig hersteld was van zijn schouderblessure. De Sooners verloren de wedstrijd, 21-20. Jones gooide één touchdown, maar maakte ook een fout diep in het veld van de Sooners, waardoor Miami scoorde in de volgende wedstrijd. De volgende week tegen Baylor kon Sam Bradford terugkeren en werd Landry opnieuw gedegradeerd tot de reserve quarterback plek. De Oklahoma aanval was traag en inconsistent op sommige momenten, maar was gemakkelijk in staat om de Bears te verslaan en keek uit naar de Red River Rivalry met Texas. Tijdens de tweede offensieve serie van de wedstrijd viel Bradford weer uit met dezelfde schouderblessure en Landry moest weer in actie komen tegen een zeer stout verdedigingslinie van Texas. Geteisterd door turnovers en fouten van een onervaren offense, verloren de Sooners een nipt duel met de Longhorns, 16-13. Jones wist met een touchdown pass naar wide receiver Ryan Broyles de wedstrijd in het derde kwart gelijk te trekken.
Jones werd de starter voor de rest van het seizoen, toen Sam Bradford aankondigde dat hij een operatie aan zijn schouder zou ondergaan om het seizoen te beëindigen en vervolgens vervroegd zou vertrekken naar de NFL draft. Met grote schoenen te vullen, Jones langzaam vorderde gedurende het seizoen in overwinningen tegen Kansas, Kansas State, en Texas A&M evenals enkele slechte prestaties in verliezen tegen Nebraska (5 intercepties) en Texas Tech. Met een dominante overwinning op BCS-kanshebber Oklahoma State, kregen de Sooners een bid om te spelen in de 2009 Sun Bowl tegen Stanford. Jones had zijn beste passing performance van het jaar met 418 yards en 3 touchdown passes naar Ryan Broyles, waardoor de Sooners hun eerste bowl-overwinning sinds 2005 behaalden en het team op weg ging naar een optimistisch 2010 waarin Landry een volledig lente- en herfstkamp zou hebben om zich voor te bereiden als startende quarterback.
Seizoen 2010Edit
In 2010 behield Jones zijn startpositie als quarterback van Oklahoma en loodste hij het team naar de eerste vier out-of-conference-overwinningen. Hij zette zijn dominante prestatie voort in de Red River Shootout, en versloeg Texas met 28-20. Na de sterke start kreeg Jones tegen Missouri zijn eerste tegenslag te verwerken door de wedstrijd met 36-27 te verliezen. Hij zou Oklahoma leiden in een opleving met een paar topprestaties voordat hij de tweede en laatste tegenslag van het seizoen kreeg tegen Texas A&M. Na de nederlaag zou Jones de ploeg weer opkrabbelen door de rest van het seizoen te winnen, inclusief een langverwachte wedstrijd tegen de Oklahoma State Cowboys in de jaarlijkse Bedlam Series. De wedstrijd werd pas in de laatste minuut beslist, maar de ongelooflijke passprestatie van Jones leidde Oklahoma met een score van 47-41 langs zijn rivaal uit de thuisstaat.
Op grond van een tie-breaker moest Oklahoma het in de Big 12 Championship Game opnemen tegen zijn befaamde rivaal Nebraska. Na een achterstand van 17 punten, leidde Jones de Sooners naar een comeback met 23-20 overwinning. Na de overwinning ging Oklahoma naar de Fiesta Bowl als de kampioen van de Big 12 Conference, tegenover Connecticut als de kampioen van de Big East Conference. Oklahoma ging de wedstrijd in om zijn recente reeks van BCS bowl-verliezen te doorbreken, terwijl Connecticut zijn eerste BCS bowl ooit speelde. Jones had een geweldige avond en droeg zijn team over Connecticut met een ruime score van 48-20 om de BCS bowl verliesreeks te doorbreken en Oklahoma’s eerste BCS bowl sinds 2002 te winnen.
2011 seizoenEdit
In 2011 leidde Jones de Sooners op dominante prestaties tegen openingsvijanden zoals Tulsa en Florida State. Hij zou de prestatie van vorig jaar in de Red River Shootout overtreffen door Texas te verslaan met een score van 55-17. De Sooners leden hun eerste nederlaag tegen Texas Tech, met een score van 44-41 in eigen huis na twee gemiste velddoelpunten. Hij zou de dominantie van Oklahoma voortzetten voordat hij zijn belangrijkste wide receiver Ryan Broyles verloor aan een knieblessure tegen Texas A&M. Na het verlies kwam Jones in een dip met twee nederlagen tegen de Baylor Bears en de Oklahoma State Cowboys. Jones leidde de Sooners uiteindelijk naar een overwinning in de Insight Bowl tegen de Iowa Hawkeyes, waardoor de Sooners opnieuw een seizoen met dubbele cijfers wonnen.
Seizoen 2012Edit
Op 5 januari 2012 kondigde Jones aan dat hij zou terugkeren naar Oklahoma voor zijn laatste seizoen. In 2012 leidde hij de Sooners naar een 10-2 record (8-1 in de Big 12), en deelde het Big 12 Conference Championship met Kansas State. Jones’s turnovers waren het verschil in een verlies aan het begin van het seizoen tegen Kansas State, maar hij speelde goed gedurende de rest van het seizoen. Ze stonden tegenover voormalig Big 12 lid, Texas A&M in de Cotton Bowl Classic, waar ze met 41-13 verloren. Jones eindigde het seizoen met een completion percentage van 66 procent met 4.267 passing yards, 30 touchdowns, en 11 interceptions. Hij sloot zijn collegiale carrière af met 16.646 passing yards en 123 touchdowns.