Thomas A. Anderson is geboren in Lower Downtown, Capital City, USA op 11 maart 1962 volgens zijn strafblad, of 13 september 1971 volgens zijn paspoort (beide te zien in de film). Zijn moeder was Michelle McGahey (de naam van de art director van de eerste film) en zijn vader was John Anderson. Hij ging naar Central West Junior High en Owen Patterson High (genoemd naar de productieontwerper van de film). Op de middelbare school blonk hij uit in natuurwetenschappen, wiskunde en computerlessen, en toonde hij aanleg voor literatuur en geschiedenis. Hoewel hij op dertien-veertienjarige leeftijd disciplinaire problemen had, groeide Anderson uit tot een gerespecteerd lid van de schoolgemeenschap door zijn betrokkenheid bij voetbal en hockey.
Aan het begin van de serie is Neo een van de miljarden mensen die neuraal zijn verbonden met de Matrix, zonder te beseffen dat de wereld waarin hij leeft een gesimuleerde werkelijkheid is.
The MatrixEdit
In zijn legitieme activiteiten is hij een stille programmeur voor het “respectabele softwarebedrijf” Meta Cortex; maar hij is ook een computerhacker die op illegale wijze computersystemen binnendringt en informatie steelt onder zijn hackersalias “Neo”, en hij verkoopt ook illegale onvindbare computersystemen en hackprogramma’s, samen met het beheersen van computervirussen die op cd’s en diskettes zijn verstopt. Gedurende zijn tijd als hacker is Anderson iets te weten gekomen dat alleen bekend staat als “The Matrix”. Het wordt beschreven als een vaag idee dat Neo zijn hele leven al heeft dat “er iets mis is met de wereld”.
In de jaren voorafgaand aan de gebeurtenissen in The Matrix heeft Neo zijn tijd doorgebracht met het zoeken naar de enige man van wie hij dacht dat hij hem kon vertellen wat de Matrix was: een vermeende terrorist die alleen bekend is onder de naam Morpheus. Na een ontmoeting met een andere hacker, Trinity, wordt Anderson plotseling gecontacteerd door Morpheus via een mobiele telefoon die naar zijn kantoor is gemaild, maar hij wordt vrijwel onmiddellijk gevangen genomen door de agenten van de virtuele realiteit, onder leiding van Agent Smith. Nadat hij weigert met de agenten samen te werken, laat Neo een elektronisch afluisterapparaatje in zijn door de Matrix gesimuleerde lichaam implanteren, zodat zijn daden kunnen worden gevolgd en degenen die vanuit de vrije wereld contact willen maken, kunnen worden opgespoord en vernietigd. Vervolgens neemt Trinity contact met hem op, bevrijdt hem van het afluisterapparaat en brengt hem naar Morpheus.
Neo krijgt de keuze om in zijn dagelijks leven te blijven en de Matrix te vergeten of om te leren wat de Matrix werkelijk is. Hij kiest ervoor om te leren wat de Matrix werkelijk is en neemt een medicijn (meestal de “rode pil” genoemd) dat is ontworpen om de neurale verbinding van zijn lichaam met de Matrix te verbreken. Hij wordt gedesoriënteerd en geschrokken wakker en ontdekt dat hij zwak, haarloos en naakt is, in een capsule vol met, naar men aanneemt, kunstmatig vruchtwater. Ook ontdekt hij dat hij is aangesloten op een reeks dikke kabels, door middel van een aantal stekkers die op zijn lichaam zijn geënt. Na zijn “geboorte” in de echte wereld wordt hij ontdekt door een machine, die Neo aanziet voor een lijk, hem bij de nek grijpt en al zijn stekkers en kabels verwijdert voordat hij hem uit zijn vloeistofreservoir spoelt. Vervolgens verdrinkt hij bijna in een zwembad op de bodem van de elektriciteitscentrale waar zijn tank zich bevond.
Neo wordt gered in de echte wereld en zijn lichaam wordt genezen van de gevolgen van zijn atrofie opgelopen in de elektriciteitscentrale. Als Neo weer bij bewustzijn is en kan lopen, vertelt Morpheus Neo de waarheid over de Matrix: dat het een gesimuleerde wereld is waarmee mensen zijn verbonden, en dat de mensheid wordt gebruikt als energiebron voor reusachtige intelligente machines. Hij vertelt Neo ook over The One, een mens met de macht om de Matrix te manipuleren, van wie is voorspeld dat hij een einde zal maken aan de oorlog tussen mens en machine, en zegt dat hij gelooft dat Neo The One is. De volgende dag begint Neo aan zijn “training” en leert hij vele gevechtsvormen, voertuig- en wapenkennis door verschillende trainingsprogramma’s rechtstreeks in zijn brein te laten uploaden. Hij krijgt ook verdere instructies van Morpheus over onderwerpen als het “bevrijden van zijn geest” van de beperkingen van de Matrix, in wezen het overwinnen van de natuurkundige motor waar de Matrix op werkt. Hij wordt ook gewezen op het bestaan van de Agents, programma’s die door de machines zijn ontworpen om de orde en de overheersing over het menselijk ras te handhaven en die zijn gemaakt met vaardigheden als het ontwijken van kogels, hard rennen, over grote afstanden springen en het fysiek bezitten van mensen in The Matrix. Als ze worden gedood, vinden ze gewoon een nieuwe gastheer om te overwinnen.
Na enkele dagen aan boord van Morpheus’ hovercraft, de Nebuchadnezzar, wordt Neo meegenomen om het Orakel te ontmoeten, die in de gesimuleerde wereld de macht van de vooruitziende blik heeft. Zij vertelt hem dat hij de “gave” heeft, maar dat hij op iets lijkt te wachten, en dat hij in zijn huidige leven niet de ware is. Het Orakel waarschuwt hem dat er een situatie zal ontstaan waarin hij zal moeten kiezen tussen het redden van zijn eigen leven of dat van Morpheus.
Terugkerend van het Orakel naar de harde lijn, die dient als uitgang voor “rode pillen” om The Matrix te verlaten, wordt de bemanning van Morpheus’ schip verraden door Cypher, een “rode pil” die bereid is de agenten Morpheus te geven in ruil voor de belofte mentaal gewist te worden en voorgoed te worden verbonden met de Matrix als ontsnapping aan de somberheid van de echte wereld. In de Matrix vermoorden SWAT-troepen Mouse. Cypher springt eruit en grijpt een bliksemkanon uit de echte wereld, waardoor Tank gewond raakt en Dozer wordt gedood. Hij doodt Apoc en Switch, die nog steeds zijn aangesloten, door hun verbindingen voortijdig te verbreken. In de Matrix verslaat Smith Morpheus en neemt hem gevangen. Neo en Trinity proberen de verbinding te verbreken, maar Cypher dreigt hen ook te ontkoppelen. Hij wordt echter gedwarsboomd door Tank, die Cypher doodt en Neo en Trinity helpt de verbinding te verbreken.
Neo komt erachter dat de Agents Morpheus’ brein willen hacken en hem dwingen de toegangscodes van het mainframe in de verborgen rebellenstad Zion aan hen te vertellen. Na te hebben geweigerd Morpheus op te offeren om dit te voorkomen, besluit Neo in te breken in het gebouw waar hij wordt vastgehouden. Hij en Trinity vechten zich een weg naar het dak van het gebouw, waar ze worden geconfronteerd met Agent Jones. Neo ontlaadt twee magazijnen op Jones terwijl hij elke kogel moeiteloos ontwijkt. Als Jones terugschiet, bewijst Neo dat hij zelf ook kogels kan ontwijken. Hij beweegt zich vloeiend op een manier die alleen van een agent verwacht wordt, al is hij nog niet zo snel als zij, want zijn been wordt door een kogel geschampt. Trinity schiet Jones vervolgens van dichtbij neer. Met behulp van een bewapende helikopter, redden Neo en Trinity met succes Morpheus. Omdat Neo zojuist met succes kameraden heeft gered uit een gebouw dat wordt beschermd door zwaar bewapende bewakers en agenten (een ongekende prestatie), geloven Tank en Morpheus beiden dat Neo inderdaad The One is. Neo probeert Morpheus te vertellen wat het Orakel hem heeft verteld, maar Morpheus legt uit dat zij Neo alleen heeft verteld wat hij moest horen: als hij had geloofd dat hij de Ene was, had hij waarschijnlijk niet geprobeerd hem te redden, wat een noodzakelijke stap was voor zijn opkomst als de Ene.
Als Morpheus en Trinity de harde lijn hebben bereikt, keren ze terug naar de echte wereld, maar Neo wordt in de val gelokt door Agent Smith. Trinity maant Neo te vluchten, maar hij houdt voet bij stuk, omdat hij begint te geloven dat hij misschien de Ene is. De twee trekken wapens en vuren leeg, maar weten elkaars vuur moeiteloos te ontwijken. Neo gaat vaardig de strijd aan met Smith in een gevecht van man tot man, waarbij hij bijna de gelijke van Smith lijkt te zijn. Uiteindelijk wordt Neo kortstondig uitgeschakeld en vastgehouden door Smith terwijl een metrotrein nadert, maar op het laatste moment weet hij zich te bevrijden en met een backflip het perron op te klimmen, waardoor Smith wordt overreden. De Agent neemt echter bezit van het lichaam van de conducteur en komt uit de trein en Neo, zich realiserend dat het vermogen van de Agents om andere lichamen te bezitten maakt dat dit een gevecht is dat hij niet kan winnen, vlucht uit het metrostation.
Opgejaagd door Smith en zijn collega-agenten, Neo is in staat om hen te ontwijken en de locatie van de harde lijn te bereiken, alleen om in een hinderlaag te lopen en dodelijk in de borst geschoten te worden door Smith. Trinity, die Neo in de echte wereld ziet sterven terwijl zijn geest zich nog in de Matrix bevindt, vertelt zijn kennelijk levenloze lichaam dat het Orakel had voorspeld dat zij verliefd zou worden op The One. Als hij door Trinity wordt gekust, komt Neo weer tot leven en ontpopt hij zich eindelijk volledig als The One. Als The Agents hem weer proberen te doden, steekt Neo simpelweg zijn hand op en de kogels bevriezen in de lucht, waarna ze onschadelijk op de grond vallen. Dan blijkt dat hij in staat is de computercode van de Matrix waar te nemen, te interpreteren en te veranderen. Hij gelooft volledig in zijn nieuwe krachten en weert moeiteloos Agent Smith af voordat hij zich in het lichaam van de agent wringt en het van binnenuit vernietigt. De andere twee agenten vluchten snel.
Neo laat vervolgens via de telefoon een boodschap achter voor de machines; een waarschuwing dat hij van plan is zich tegen de machines te verzetten door zoveel mogelijk menselijke geesten te bevrijden. Vervolgens hangt hij op en vliegt de lucht in, nu hij zijn definitieve metamorfose als The One volledig heeft ondergaan.
The Matrix ReloadedEdit
Op ongeveer zes maanden tussen de gebeurtenissen in de eerste film en The Matrix Reloaded heeft Neo nu het volste vertrouwen in zijn vermogen om de kunstmatige wereld binnen de Matrix te manipuleren. Hij gebruikt in de hele film geen vuurwapens en vertrouwt alleen nog maar op het gevecht van man tot man. Zijn vermogen om de codering van de Matrix te manipuleren stelt hem in staat om inkomend vuur van meerdere aanvallers te stoppen. In plaats van de lange zwarte trenchcoat en het zwarte overhemd dat hij aan het eind van The Matrix draagt, draagt Neo nu een soutane met een hoge mandarijnkraag, die doet denken aan een priester of bisschop. Hij en Trinity zijn nu geliefden. Neo vraagt meer advies aan het Orakel, onzeker over zijn doel, terwijl Zion zich voorbereidt op een massale aanval door de Machines van meer dan 250.000 Sentinels – reusachtige kwallen-achtige machines. Het Orakel stuurt hem op een zoektocht naar de Sleutelmaker, een gepersonifieerd programma dat toegang heeft tot talloze achterdeurtjes in het systeem. De Sleutelmaker zal Neo veilig naar de Bron kunnen leiden, het programmeerhart van de machinewereld dat de programma’s bevat die de Matrix in stand houden.
Nadat het Orakel is vertrokken, verschijnt Agent Smith (nu gewoon bekend als Smith), en wordt onthuld dat Neo Smith van de rest van de Matrix-code heeft gescheiden door hem te verbrijzelen, waardoor hij een leven heeft gekregen onafhankelijk van de systemen van de machine, en nu delen de twee een “connectie” met elkaar. Smith is niet langer een Agent van de Matrix, maar is meer virusachtig geworden, in staat om zijn code in andere systemen in te voegen en andere programma’s en menselijke geesten te infecteren om kopieën van zichzelf te maken. Neo weert honderden van deze Smiths af en ontsnapt. Later stelen hij, Morpheus en Trinity de Keymaker van zijn bewaarder, de Merovingian. In die tijd blijft Neo achter om de mannen van de Merovingian af te weren en raakt gescheiden van de anderen. Hij zit gevangen in het landhuis van de Merovingian, vijfhonderd kilometer verderop in de bergen. Hij vliegt weg om hen te helpen en komt alleen op tijd aan om Morpheus en de Sleutelmaker te redden van twee agenten die twee vrachtwagens tegen elkaar laten botsen.
De Sleutelmaker legt uit dat twee elektriciteitscentrales elders in de Matrix in een kort tijdsbestek moeten worden uitgeschakeld om met succes het beveiligingssysteem van een gebouw uit te schakelen waar de deur naar de Bron zal verschijnen, zodat Neo die kan bereiken. Deze taak wordt volbracht; maar de Sleutelmaker wordt gedood, een hovercraft wordt vernietigd, en Trinity wordt in gevaar gebracht door Agents of the Matrix; een visioen dat Neo eerder in zijn dromen heeft gezien. Als Neo de deur binnengaat, wordt hij geconfronteerd met de Architect, een programma dat The Matrix heeft bedacht en ontworpen.
De Architect geeft Neo een radicaal andere uitleg van zijn afkomst en doel, door te beweren dat Neo eigenlijk de zesde “Ene” is. Hij zegt verder dat Zion al vijf keer eerder door de machines is vernietigd; voor het dilemma de mensheid te laten vernietigen of toe te staan dat de status quo die de machines verkiezen wordt herbouwd, hebben Neo’s vijf voorgangers geholpen de Matrix te herladen, of opnieuw op te starten, voordat zij toestemming kregen Zion te herbouwen met een handjevol bevrijde mensen. De produktie van de Matrix is gebaseerd op deze herhaalde cyclus van vernietiging en herschepping, om de menselijke geesten die de Matrix aandrijven in een stabiele structuur te houden. Het Orakel is net zo’n onderdeel van dat zichzelf in stand houdende ontwerp als de Architect, zo wordt Neo verteld, en de profetie van The One is ontworpen om ervoor te zorgen dat het elke keer weer soepel verloopt.
De Architect waarschuwt voor de vernietiging van al het menselijk leven in en buiten de Matrix als hij niet door de Brondeur zou gaan om de Matrix opnieuw te laden, maar in tegenstelling tot zijn voorgangers gaat Neo niet door de Brondeur; hij kiest ervoor niet te geloven in de waarschuwingen van de Architect voor de gevolgen, en in plaats daarvan Trinity te redden. Als hij terugkeert naar de Matrix, vangt hij Trinity op als zij uit een raam van de bovenste verdieping van een elektriciteitscentrale valt. Ze sterft aan een schotwond in haar hart die ze tijdens de val oploopt, maar Neo brengt haar weer tot leven door in haar virtuele lichaam te reiken, de kogel te verwijderen en haar hart weer op gang te brengen.
Samen verlaten ze de Matrix en keren terug naar de echte wereld. Neo vertelt Morpheus dat de Profetie slechts een ander controlesysteem was, en dat de vernietiging van Zion aanstaande is. Een groep Sentinels begint hun hovercraft te bestormen, zodat Neo en de anderen gedwongen zijn de hovercraft te verlaten en te vluchten als deze wordt vernietigd. Neo blijft achter en realiseert zich dat hij de Sentinels nu kan aanvoelen, en houdt ze met wilskracht tegen om aan te vallen, maar hij valt daarbij bewusteloos neer. Hij en de bemanning worden gered door het hovercraft Mjolnir (ook bekend als de Hammer), waarvan de bemanning te maken heeft met een mysterie in de vorm van Bane, een bemanningslid van een ander schip, die de enige overlevende is van een noodlottige aanval van de Zion vloot. Onbekend voor wie dan ook, is Bane gevangen en geïnfecteerd door Smith.
The Matrix RevolutionsEdit
The Matrix Revolutions begint direct na de gebeurtenissen van de tweede film. Als gevolg van zijn strijd met de Sentinels komt Neo weer bij bewustzijn en bevindt hij zich in een geïsoleerde, stationachtige limbo die alleen toegankelijk is op bevel van de Merovingian, en waaruit zijn geest zich niet kan bevrijden. Hier ontmoet hij Sati, een jong programma dat zonder doel is gemaakt en door haar ouders, die ook programma’s zijn in de wereld van de machines, de Matrix wordt binnengesmokkeld. Neo blijft gevangen totdat hij wordt bevrijd door Trinity (bijgestaan door Morpheus en Seraph) die de Merovingian bedreigt in een Mexicaanse impasse.
Na een laatste bezoek aan het Orakel komt Neo erachter dat hij krachten heeft over de machines die verder reiken dan de Matrix en dat Smith zich aan het verspreiden is, waardoor zowel de Matrix als de echte wereld dreigt te worden vernietigd. Voortbordurend op de eerdere uitleg van het Orakel over de aard van de keuze, leert Neo dat de bewering van de Architect dat zijn keuze om Trinity te redden inherent zou leiden tot het uitsterven van de mensheid onjuist was, omdat zijn aard als puur wiskundig wezen hem niet in staat stelt keuzes uit het verleden van mensen te zien, omdat hij hen slechts als variabelen in vergelijkingen beschouwt. Nadat Neo is verteld dat hij nu de macht heeft om te kiezen voor het beëindigen van de oorlog en het verslaan van Smith, zegt het Orakel: “Alles wat een begin heeft, heeft een einde, Neo” en vertelt hem dat hij nu naar het zwaar bewaakte Machine City moet gaan in de hoop de Sentinels en Smith te stoppen. Kort na Neo’s vertrek komen tientallen Smiths en assimileren Seraph, Sati en het Orakel.
Neo en Trinity krijgen de Logos, een hovercraft bestuurd door Morpheus’ voormalige geliefde, Niobe, in wat voor anderen lijkt op een suïcidale reis naar de Machine Stad. Ondertussen keren Kapitein Roland en de overlevende bemanning van de Nebuchadnezzar, Link en Morpheus, in de hovercraft Hammer/Mjolnir terug naar Zion, dat nu belegerd wordt en verliest van de Machines. Neo en Trinity worden in een hinderlaag gelokt door de verstekeling Bane/Smith, die Neo verblindt met een elektrische kabel, maar wordt gedood wanneer Neo een vermogen ontdekt om programma’s en Machines te ‘zien’ onafhankelijk van zijn gezichtsvermogen waaruit blijkt dat de ‘echte wereld’ buiten de Matrix slechts een andere laag van simulatie is. Neo, met Trinity als piloot, leidt de Logos langs de verdedigingswerken van Machine City, maar in de poging de Logos te laten neerstorten, loopt Trinity dodelijke verwondingen op en sterft.
Neo ontmoet de Deus Ex Machina, een gigantische Machine-constructie en de feitelijke leider van de Machines. Hij biedt Smith zijn nederlaag en vernietiging aan in ruil voor een wapenstilstand. Het aanbod wordt aanvaard; Neo gaat de Matrix binnen om te ontdekken dat het Smith-programma zichzelf heeft gekopieerd in de hele gesimuleerde wereld, en deze heeft veranderd in een verregende donkere simulatie. Een van de kopieën van Smith, die het Orakel heeft geassimileerd en evenveel vrijheid en controle over de virtuele wereld heeft gekregen als Neo, staat alleen tegenover Neo. Een tijd lang vechten de twee gelijk op zonder echt voordeel, maar uiteindelijk begint de onvermoeibare Smith Neo uit te putten en krijgt hij de controle over het gevecht. Beseffend dat hij niet met brute kracht kan winnen en niet zonder Trinity wil leven, staat Neo toe dat Smith hem assimileert, waardoor de machines het Smith-virus direct via zijn lichaam kunnen uitroeien, hoewel Neo’s leven daarbij wordt opgeofferd.
Neo’s lichaam wordt door de machines meegenomen in de Machine City, terwijl beneden in Zion de machines hun aanval staken en zich terugtrekken uit eerbied voor de vrede die Neo heeft geruild. De Matrix wordt opnieuw opgestart en een prachtige zonsopgang verschijnt aan de horizon, gemaakt door Sati ter ere van Neo.
The Matrix OnlineEdit
Hoewel het lot van Neo nooit echt werd onthuld in het MMORPG-vervolg, The Matrix Online, had zijn invloed niettemin een sterke invloed op verschillende belangrijke gebeurtenissen in het spel.
In het begin werden verspreide codefragmenten van Neo’s “RSI” (Residual Self Image) gevonden op de lichamen van de bedrieglijke Agents die tijdens Chapter 1.1 in de Mega City verschenen (later bleken dit Sentinels te zijn onder het commando van The General program). Wanneer deze fragmenten worden vastgehouden, weerklinken enkele van de laatste gedachten van Neo in de geest van de Redpill. Elk van de drie belangrijkste naoorlogse politieke organisaties in de Matrix realiseerde zich de mogelijke betekenis van deze fragmenten en begon onderling te vechten om er zoveel mogelijk te verzamelen.
Het Orakel onthult een geheim genootschap van ballingen, alleen bekend als de Shapers, die als enigen in staat zijn de Fragmenten op een significante manier bij elkaar te brengen en dat ze moeten worden beschermd tegen de corruptie van de bedrieglijke agenten. Het wantrouwen van de Redpills en de organisatorische verschillen blijken te groot voor een sterke eenheid, zodat een Shaper in de gevangenschap van de bedrieglijke agenten viel. Zijn kracht werd gebruikt om een deel van het wezen van de Ene op hen te coderen, waardoor de krachtige, bleekhuidige “N30 Ag3nts” ontstonden.
In Hoofdstuk 1.2 zegt Morpheus dat de machines weliswaar nooit Neo’s stoffelijke resten (Neo’s lichaam in de echte wereld) naar Zion hebben teruggebracht, maar ze ook niet hebben “gerecycled”: een verwijzing naar de eerste film, waarin Morpheus Neo vertelt dat de machines overleden bewoners van de Matrix vloeibaar maken om de levende bewoners van organisch voedsel te voorzien. Dit zou de drijvende kracht worden achter Morpheus’ afgang naar fanatiek terrorisme tegen het Systeem in een poging de Machines te dwingen Neo’s lot te onthullen, wat uiteindelijk zou leiden tot zijn moord.
Het onderwerp Neo viel daarna naar de zijlijn voor andere strubbelingen tot de komst van The Oligarchs in Hoofdstuk 9. De oorspronkelijke indringer, Halborn, was met name geïntrigeerd door het leven van The One en was persoonlijk geschokt over de implicaties die Neo’s vermogen om machines buiten de simulatie te beïnvloeden had op zijn zoektocht naar wat hij noemde “The Biological Interface Program”.
Na Halborn’s verwijdering in Hoofdstuk 10 werd er weinig meer van hem vernomen tot de onthulling van het Trinity project, oorspronkelijk geleid door The Oracle, in Hoofdstuk 12. Het werd onthuld dat zowel Neo als Trinity eigenlijk het hoogtepunt waren van tientallen jaren Machine onderzoek naar het perfect vertalen van menselijk DNA naar Machine code, waardoor ze direct konden communiceren met technologie zonder de noodzaak van gesimuleerde interfaces.