Latent Infection
Latentne zakażenie neuronów czuciowych wirusemHSV polega na związaniu się wirionu z zakończeniami aksonów neuronów i przedostaniu się do aksonu, prawdopodobnie przy użyciu tych samych cząsteczek wnikania, co w przypadku zakażenia litycznego opisanego powyżej. Kapsyd przemieszcza się wzdłuż aksonu transportem wstecznym do ciała komórki neuronu, gdzie genom wirusowy jest uwalniany do jądra neuronu. Genom ulega kolokalizacji i jest powoli ładowany histonami z powodu małej puli wolnych histonów w spoczywającym neuronie; mimo to transkrypcja genów litycznych jest ograniczona z powodu braku lokalizacji VP16 w jądrze neuronu i cytoplazmatycznej lokalizacji co najmniej jednego z białek gospodarza, które tworzy kompleks z VP16 w celu aktywacji ekspresji genu IE. Głównym genem wirusowym, który ulega transkrypcji jest gen kodujący transkrypt związany z latencją (LAT), który jest długim (ponad 10 kb) niekodującym pierwotnym transkryptem RNA. LAT jest przetwarzany przez splicing w celu uzyskania stabilnego, kolistego intronu o długości 2 kb oraz kilku mikroRNA (miRNA). Ekspresja LAT promuje przeżycie zainfekowanego neuronu poprzez zwiększenie heterochromatyny na wirusowym genomie oraz zmniejszenie ekspresji wirusowych genów litycznych i hamowanie apoptozy. LAT zwiększa poziom markera heterochromatyny fakultatywnej H3K9me3 (histon H3 trimetylowany 3 resztami lizyny), prawdopodobnie poprzez rekrutację metylotransferazy histonowej 2 kompleksu represyjnego Polycomb. Fakultatywna heterochromatyna wydaje się idealna dla latentnej chromatyny HSV, ponieważ jest wyciszająca, ale stanowiłaby formę chromatyny, która jest przygotowana do reaktywacji.
Podczas utrzymywania infekcji latentnej, istnieje minimalna, ale wykrywalna ekspresja genów litycznych HSV. Ponieważ neuron jest komórką w stanie spoczynku, wirusowy genom DNA może być stabilnie utrzymywany bez replikacji lub wiązania się z chromosomami gospodarza. Niektórzy twierdzą, że komórki T CD8+ otaczające latentnie zakażony neuron utrzymują latentne zakażenie, ale alternatywnym wyjaśnieniem jest to, że celują one w reaktywujące się neurony. W każdym razie, uszkodzenie neuronu, stres i/lub aktywacja prowadzą do kinazowych szlaków sygnałowych, co do których uważa się, że fosforylują histony w wirusowej chromatynie, aby umożliwić uogólnioną transkrypcję utajonego genomu, aby zapewnić wystarczającą ilość VP16 do uruchomienia litycznej kaskady transkrypcyjnej. Pozwala to na co najmniej ograniczoną ekspresję genów wirusowych w celu utworzenia kapsydu, a kapsydy lub wirusy przemieszczają się wzdłuż aksonu transportem anterogonalnym, aby uwolnić reaktywowane na zakończeniach aksonalnych w celu wywołania nawracającej infekcji. Dyskutowano, czy reaktywujący się neuron przeżyje, czy nie, ale przeżycie neuronu jest prawdopodobnie odwrotnie proporcjonalne do poziomu ekspresji reaktywowanego genu, a nie jest efektem typu „wszystko albo nic”.