Jocul de bază urmează regulile standard ale jocului de cărți de colecție (cu excepția faptului că puteți folosi doar 1 mythic, 2 rares și 3 uncommons din orice carte) Magic: The Gathering, lansat pentru prima dată în 1993; fiecare jucător are un pachet de cărți format din terenuri și vrăji. Terenurile sunt folosite pentru a genera „mana”, resursa necesară pentru a lansa vrăji. Mana vine în cinci culori, iar cărțile pot necesita mana colorată sau generică (mana de orice culoare) pentru a fi lansate. Vrăjile vin în mai multe varietăți, de la vrăjitorii și instanți care au efecte o singură dată, până la creaturi invocate care pot ataca și se pot apăra de adversari. Jucătorii alternează pe rând jucând cărți de pământ, lansând vrăji și atacând adversarii până când totalul de viață al tuturor jucătorilor, cu excepția unuia, este redus la 0.
Magic Duels: Origins încadrează jocul de bază în jurul unui mod de poveste pentru un singur jucător, și un mod de luptă online. În modul poveste, jucătorul pășește prin povestea de origine a cinci Planeswalkers diferiți, Chandra Nalaar, Jace Beleren, Gideon Jura, Nissa Revane și Liliana Vess. Fiecare Planeswalker are cinci sau mai multe dueluri cu adversari controlați de calculator. Jucătorul folosește un pachet bazat pe Planeswalker-ul selectat și, pe măsură ce termină fiecare dintre dueluri, îmbunătățește acel pachet prin adăugarea de noi cărți preselectate. Aceste punți, cu orice îmbunătățiri pe care le-au deblocat, sunt, de asemenea, disponibile jucătorului în modul bătălie.
Modul bătălie le permite jucătorilor să folosească punți pre-făcute sau să construiască punți din colecția lor de cărți și să joace fie împotriva adversarilor computerizați, fie împotriva adversarilor online; tipurile de meciuri includ meciuri unu la unu cu jucători urmăriți pe clasamente și Two-headed Giant (doi contra doi). Adversarii computerizați în aceste moduri pot fi selectați din trei niveluri de dificultate, dificultățile mai mari aducând mai multe recompense pentru jucător. Punțile adversarilor computerizați vor fi generate procedural, randomizând efectiv tipul de punți cu care se va confrunta jucătorul. Jucând prin oricare dintre cele două moduri, jucătorii pot câștiga bani în joc care pot fi folosiți pentru a cumpăra noi pachete de rapel sau cărți specifice pentru a-și extinde biblioteca de cărți; există, de asemenea, diverse obiective zilnice pe care jucătorii le pot îndeplini pentru bani în joc, iar toți jucătorii sunt recompensați pentru că ajută la îndeplinirea diverselor obiective ale comunității. Jucătorii pot, de asemenea, să achiziționeze bani în joc prin microtransacțiuni, dar nu este necesar pentru a avea acces la toate cărțile și caracteristicile.
.