Zygomycota, sau ciupercile de conjugare, includ mucegaiurile, cum ar fi cele care invadează pâinea și alte produse alimentare. Caracteristicile de identificare ale Zygomycota sunt formarea unui zigospor în timpul reproducerii sexuate și lipsa pereților celulelor hifalice, cu excepția structurilor de reproducere. Multe dintre ele (~100 de specii) sunt cunoscute ca simbioți ai rădăcinilor plantelor.
Miceliile Zygomycota sunt împărțite în trei tipuri de hife. Rizoizii ajung sub suprafață și au funcția de absorbție a hranei. Deasupra suprafeței, sporangioforii poartă sporangii producători de spori. Grupurile de rizoizi și sporangiofori sunt conectate deasupra suprafeței prin stoloni. Pereții celulari care separă celulele individuale sunt absenți în toate structurile, cu excepția celor de reproducere, permițând citoplasmei și chiar nucleelor să se deplaseze între celule.