Als Ergebnis dieses evolutionären Prozesses trägt L. reuteri ein Leben lang zur menschlichen Gesundheit bei. Der Mensch wird nahezu steril geboren und lernt L. reuteri während des Geburtsvorgangs und beim Stillen kennen. Als wichtiges Mitglied der Darmmikrobiota spielt L. reuteri eine wichtige Rolle bei der Verdauung von Muttermilch und fester Nahrung bei Säuglingen. Im Laufe des Lebens straffen die Bakterien die Darmschleimhaut, um ein Auslaufen zu verhindern und die Immunreaktion zu verbessern. Sie setzen auch Moleküle frei, die eine gesunde und vielfältige Mikrobiota fördern und das Wachstum von Krankheitserregern verhindern. Die Unterstützung der Darmmikrobiota ist besonders in späteren Lebensjahren wichtig, da ältere Menschen dazu neigen, die Vielfalt in ihrem Darm zu verlieren.
Einige Menschen haben heute noch L. reuteri als Teil ihrer Mikrobiota, aber vielen Menschen fehlen diese Stämme aufgrund unseres modernen Lebensstils. Ballaststoffarme Ernährung, verstärkte Hygiene, der Einsatz von Antibiotika und die steigende Zahl von Kaiserschnittgeburten, bei denen die Babys dem Bakterium nicht ausgesetzt sind, haben dazu beigetragen, dass L. reuteri aus unserem Magen-Darm-Trakt verschwunden ist.
Mit Hilfe von Probiotika kann L. reuteri wieder eingeführt werden, aber sie müssen häufig nachgefüllt werden, da die Bakterien ständig aus dem Magen-Darm-Trakt ausgewaschen werden.