Prezidentství
S více než 15 000 mírovými jednotkami OSN v zemi a 80procentní nezaměstnaností čelila Johnson Sirleaf vážným výzvám. Okamžitě se snažila o oddlužení a pomoc mezinárodního společenství. Do konce roku 2010 byl celý dluh Libérie smazán a Johnson Sirleafová zajistila v zemi zahraniční investice v hodnotě milionů dolarů. Kromě toho v roce 2006 zřídila Výbor pro pravdu a usmíření (TRC), který měl prověřit korupci a zacelit etnické napětí. Ironií osudu byla Johnsonová Sirleafová v roce 2009 zmíněna v jedné ze zpráv TRC, která doporučila, aby jí spolu s řadou dalších osob byl na 30 let zakázán výkon volených funkcí za to, že v občanské válce podporovala válčící frakce. V případě Johnsonové Sirleafové šlo o to, že na počátku války po určitou dobu podporovala Taylora. Doporučení zprávy však nebyla závazná, a tak ji povzbudil široký projev domácí i mezinárodní podpory. Snaha o vymýcení korupce – významného problému, s nímž se Johnson Sirleaf zavázala skoncovat – zahrnovala vytvoření protikorupční komise v roce 2008.
Přestože se dříve zavázala, že bude prezidentkou pouze jedno funkční období, v roce 2010 Johnson Sirleafová oznámila svůj záměr kandidovat v prezidentských volbách v říjnu 2011 s tím, že má před sebou ještě mnoho práce. Měsíc před volbami však byla způsobilost Johnsonové Sirleafové napadena u soudu malou opoziční skupinou, která poukázala na ustanovení ústavy, podle něhož musí všichni prezidentští kandidáti pobývat v Libérii 10 let před volbami, což Johnsonová Sirleafová a několik dalších kandidátů nesplňovali a tento požadavek se vláda pokusila – ale neúspěšně – změnit prostřednictvím referenda v srpnu 2011. Šest dní před volbami Nejvyšší soud tuto námitku zamítl s tím, že autoři ústavy z roku 1986 nemohli předvídat roky konfliktů, které donutily mnoho Libereijců žít mimo zemi. Další předvolební kontroverze vyvolal fakt, že Johnson Sirleaf získal pouhých několik dní před volbami Nobelovu cenu míru. Ostatní kandidáti si stěžovali, že Nobelův výbor udělením ceny tak blízko voleb zasahuje do liberijské politiky.
Ve volbách 11. října 2011 kandidoval více než tucet kandidátů. Nejvíce hlasů získal Johnson Sirleaf s více než 43 % hlasů, následovaný Winstonem Tubmanem – kandidujícím společně s Weahem na viceprezidenta – který získal přibližně 32 % hlasů. Jelikož Johnson Sirleaf nezískal více než 50 procent, konalo se 8. listopadu druhé kolo voleb. To však neproběhlo tak hladce jako první kolo hlasování. Tubman a strana Kongres za demokratickou změnu vznesli obvinění z nesrovnalostí při hlasování v prvním kole. Ačkoli byla tato obvinění všeobecně odmítnuta jako nepodložená, přesto vrhla stín na druhé kolo hlasování, protože Tubman oznámil, že se vzdává kandidatury, a vyzval voliče, aby volby bojkotovali. Ačkoli byla Johnsonová Sirleafová znovu zvolena se ziskem o něco více než 90 % hlasů, její vítězství bylo zkaleno Tubmanovým odstoupením a nízkou volební účastí, která byla méně než poloviční oproti prvnímu kolu.
Ačkoli se vláda Johnsonové Sirleafové snažila korupci omezit, zůstávala problémem i během jejího druhého funkčního období. Administrativu zasáhly také stížnosti na nepotismus, přičemž sama Johnson Sirleafová se v roce 2012 dostala pod palbu kritiky, protože některé z jejích dětí zastávaly vysoké funkce ve vládě nebo státních podnicích. Během druhého funkčního období Johnsonové Sirleafové pokračoval hospodářský pokrok, dokud zemi v roce 2014 nezasáhlo ničivé onemocnění virem ebola. Během následujících dvou let nemoc zabila více než 4 800 Liberečanů, ochromila ekonomiku země a vymazala mnoho z těžce vybojovaných úspěchů země z předchozího poválečného desetiletí.
Když se země pokoušela z eboly vzpamatovat, Johnson Sirleafová, ústavně omezená na dvě prezidentská období, se po prezidentských volbách v roce 2017 chystala odstoupit. Její protikandidát z předchozích dvou voleb a současný viceprezident Libérie Joseph Boakai se stal prezidentským kandidátem její politické strany Strana jednoty (UP). Po prvním kole hlasování ji však UP obvinila, že podporovala jiného prezidentského kandidáta: svého předchozího soupeře George Weaha. Přestože obvinění důrazně popřela, obvinění přetrvávala a v lednu 2018 ji UP ze strany vyloučila. Později téhož měsíce, 22. ledna, odstoupila z funkce liberijské prezidentky a předala moc Weahovi, který se stal vítězem druhého kola hlasování. Jednalo se o první předání moci mezi demokraticky zvolenými vůdci v Libérii od roku 1944.
Jako uznání za to, že Johnsonová Sirleafová vedla Libérii během náročného přechodného období po ničivých letech konfliktu v zemi, a za pozitivní změny, ke kterým v Libérii za její vlády došlo, jí byla v únoru 2018 udělena Ibrahimova cena za úspěchy v africkém vůdcovství za rok 2017. Ocenění poskytlo 5 milionů dolarů, vyplácených po dobu 10 let, a následné roční stipendium ve výši 200 000 dolarů po zbytek života Johnsonové Sirleafové. Přinesla také možnost, aby nadace po dobu 10 let každoročně udělovala 200 000 dolarů na dobročinné účely, které Johnson Sirleafová podporovala.