Oxygenní fotosyntetické organismy využívají chlorofyl k zachycení světelné energie a oxidují vodu, kterou „štěpí“ na molekulární kyslík. Naproti tomu anoxygenní fotosyntetické bakterie mají pro zachycení světelné energie látku zvanou bakteriochlorofyl – která absorbuje převážně na jiných než optických vlnových délkách -, žijí ve vodním prostředí a pomocí světla oxidují spíše chemické látky, jako je sirovodík, než vodu.
EkologieEdit
V ekologickém kontextu jsou fototrofy často zdrojem potravy pro sousední heterotrofní organismy. V suchozemském prostředí převažují rostliny, zatímco ve vodním prostředí se vyskytuje celá řada fototrofních organismů, jako jsou řasy (např. chaluhy), další protisty (např. eugleny), fytoplankton a bakterie (např. sinice). Hloubka, do které může sluneční nebo umělé světlo proniknout do vody, aby mohla probíhat fotosyntéza, se nazývá fotická zóna.
Sinice, což jsou prokaryotické organismy, které provádějí kyslíkovou fotosyntézu, obývají mnoho prostředí, včetně sladkých vod, moří, půdy a lišejníků. Sinice provádějí fotosyntézu podobnou fotosyntéze rostlin, protože organely v rostlinách, které provádějí fotosyntézu, pocházejí z endosymbiotické sinice. Tato bakterie může využívat vodu jako zdroj elektronů k provádění reakcí redukce CO2. Z evolučního hlediska mohla schopnost sinic přežívat v kyslíkatých podmínkách, které jsou pro většinu anaerobních bakterií považovány za toxické, poskytnout bakteriím adaptivní výhodu, která mohla sinicím umožnit efektivnější osídlení.