La enfermedad suele ser mortal 3; entre los casos bien documentados, solo se conocen cinco supervivientes en Norteamérica: uno de Estados Unidos en 1978 5, uno de México en 2003 6, dos de Estados Unidos en 2013 4, 7, 8 y uno de Estados Unidos en 2016. El estado del superviviente estadounidense original mejoró gradualmente durante una hospitalización de un mes. El único efecto secundario notificado al tratamiento fue una reducción de la sensibilidad en las piernas durante dos meses después del alta, que mejoró gradualmente. Tampoco se detectó Naegleria fowleri 3 días después del tratamiento 5. Se ha sugerido que la cepa de Naegleria fowleri del superviviente original puede haber sido menos virulenta, lo que contribuyó a la recuperación del paciente. En experimentos de laboratorio, la cepa de la superviviente de California no causó daños en las células tan rápidamente como otras cepas, lo que sugiere que es menos virulenta que las cepas recuperadas de otros casos mortales 9.
El estado de la superviviente de México no empezó a mejorar hasta 40 horas después del ingreso en el hospital. El día 22 del ingreso, no se mostró ninguna anormalidad en el escáner cerebral y el paciente fue dado de alta al día siguiente. El paciente fue seguido durante los siguientes 12 meses sin ninguna recurrencia de la enfermedad 6.
Después de 35 años sin un superviviente de Naegleria en Estados Unidos, durante el verano de 2013, dos niños con infección por Naegleria fowleri sobrevivieron. La primera, una niña de 12 años, fue diagnosticada con PAM aproximadamente 30 horas después de enfermar y se le inició el tratamiento recomendado en 36 horas. También recibió el fármaco en investigación miltefosina, y su inflamación cerebral se trató de forma agresiva con tratamientos que incluían hipotermia terapéutica (enfriamiento del cuerpo por debajo de la temperatura corporal normal). Esta paciente se recuperó totalmente desde el punto de vista neurológico y volvió a la escuela. Su recuperación se ha atribuido al diagnóstico y tratamiento tempranos y a las nuevas terapias que incluyen miltefosina e hipotermia 7.
El segundo niño, de 8 años, también se considera un superviviente de la PAM, aunque ha sufrido lo que probablemente sea un daño cerebral permanente. También fue tratado con miltefosina, pero fue diagnosticado y tratado varios días después de que comenzaran sus síntomas. La hipotermia terapéutica no se utilizó en este caso 8.
En el verano de 2016, se informó de un chico de 16 años como el cuarto superviviente de la PAM en Estados Unidos. Este paciente fue diagnosticado a las pocas horas de presentarse en el hospital y fue tratado con el mismo protocolo utilizado para el superviviente de 12 años de 2013. Este paciente también se recuperó completamente desde el punto de vista neurológico y volvió a la escuela.
En general, las perspectivas para las personas que contraen esta enfermedad son malas, aunque el diagnóstico temprano y los nuevos tratamientos podrían aumentar las posibilidades de supervivencia.