Chamulában egy olyan templom található, amely nem hasonlít a többihez, bár ez kívülről nem is látszik. A festői, évszázados Iglesia San Juan fehérre meszelt falakkal és fényesre festett bejárattal rendelkezik, amely a város főterére néz. Odabent azonban az istenimádók egyedülálló rituálékat tartanak, amelyekben katolikus szentek, holdfény, érzelemkitörések és állatáldozatok szerepelnek.
A belépéskor a látogatókat elárasztja a kopálgyanta füstölő illata és a több ezer gyertya füstje. A falakat szentek szobrai szegélyezik, amelyeket tükrökkel díszítettek, hogy elűzzék a gonoszt. Nincsenek padok; az egyébként üres padlót elölről hátrafelé friss fenyőtűk borítják.
A hívek kis csoportokban terültek el. Minden család kisöpör magának egy szabad helyet, és egy válogatott gyertyát ragaszt közvetlenül a csempékre. Hagyják, hogy a gyertyák teljesen leégjenek a személyes szertartásuk alatt és után, sokszínű viasztócsákat hagyva maguk után. Az imádkozók hangosan imádkoznak tzotzilul, néha sírva, és többször is megteszik a kereszt jelét. Coca-Colát és “pox”-ot – a regionális párlatot – isznak, és böfögnek azzal a szándékkal, hogy kiűzzék a rosszindulatú szellemeket. Néha a családhoz egy curandero is csatlakozik, aki ráteszi a kezét a szenvedőre, egy tyúktojásba szívja a betegségüket, vagy egy élő tyúkot lengetve a fejük fölött meggyógyítja őket. Szélsőséges esetekben aztán ott helyben megölik a csirkét.
A katolikus és az őslakosok hitének ez az egyedülálló keveréke 500 évnyi kulturális versengés eredménye. Nem sokkal az 1520-as években történt megérkezésük után a spanyolok elkezdték az őslakosok lelkiségének egyes aspektusait magukévá tenni, hogy a helyi majákat megnyugtassák. Később az őslakosok elkezdték vegyíteni hagyományos rítusaikat a misszionáriusok által bevezetett katolikus rítusokkal.
A katolikus chamulánok és az egyre növekvő számú protestáns áttértek közötti belső feszültségek a 20. század folyamán folyamatosan nőttek, és az áttérteket erőszakkal száműzték a közösségből. Az 1970-es években a katolikus egyházmegye a misék visszatartásával igyekezett csillapítani a konfliktust Chamulában, valamint leállítani néhány bennszülött rituálét. De Chiapasnak ez a területe, amely a baloldali zapatista lázadóknak ad otthont, a heves függetlenség hírében áll. Ahelyett, hogy engedelmeskedtek volna, a chamulaiak saját vallási vezetőiket állították be, és elhagyták a szokásos katolikus szertartás minden látszatát. Ma a közösség kapcsolata a hagyományos papokkal a havi keresztelési látogatásokra korlátozódik. A külső látogatók nem ismerik fel katolikusnak a napi szertartásokat, amelyeknek tanúi lehetnek.