Az Undertale-nek három különböző fő befejezése van (Neutral, True Pacifist és Genocide) és egy negyedik különböző befejezés (Hard Mode).
Neutral Route
Ennek az útvonalnak a részletesebb magyarázatát lásd a Neutral Route oldalon.
Ez a befejezés akkor következik be, ha az alábbi feltételek valamelyike teljesül:
- A főhős nem barátkozik a cselekmény összes kulcsszereplőjével (Papyrus, Undyne, Alphys).
- A True Lab nem került felfedezésre.
- A főhős megöl bármely, de nem minden szörnyet.
A Neutral Route azzal végződik, hogy a főhős egyedül menekül az Undergroundból. Ennek a befejezésnek többféle lehetséges változata létezik, a játék során hozott döntésektől függően.
Az Igazi pacifista útvonal
Ennek az útvonalnak a részletesebb magyarázatát lásd: Igazi pacifista útvonal.
Ez a befejezés akkor következik be, ha az alábbi feltételek mindegyike teljesül:
- A semleges útvonal teljesült. (Visszaállítás nem szükséges, csak a játékos SAVE fájljának újratöltése utána.)
- Nem öltek meg szörnyeket a játék során. (A főszereplő nem szerezhet EXP-et, és ennek következtében nem juthat tovább LV 1-nél.)
- Papyrus, Undyne és Alphys összebarátkoztak.
- Az Igazi Labort felfedezték.
Az Igazi Pacifista útvonal azzal ér véget, hogy a gát áttörik, és a főszereplő és az alvilági szörnyek elhagyhatják. Ezen kívül ez az útvonal tartalmazza a True Pacifist Ending Credits-et.
Genocide Route
Ennek az útvonalnak a részletesebb magyarázatát lásd: Genocide Route.
Ez a befejezés csak akkor következik be, ha minden területen (Romok, Snowdin Forest, Waterfall, Hotland/CORE) az összes ellenséget megöljük, amíg senki sem marad. Ez az összes főnököt is magában foglalja.
A Genocide Route befejezése a játék világának elpusztulásához vezet. A játék újraindításakor a Genocide Route befejezése után az első ember megkéri a főhőst, hogy adja át neki a LELKÉT a világ újjáteremtéséért cserébe. Ez gyakorlatilag ugyanúgy működik, mint egy True Reset az True Pacifist Route-ból, de véglegesen megváltoztatja a későbbi Genocide vagy True Pacifist befejezések végét is (Soulless Genocide & Soulless Pacifist). A népirtás útvonal utáni semleges befejezéseket ez nem érinti.
Kemény mód
Ennek az útvonalnak a részletesebb magyarázatát lásd: Kemény mód.
Ez a mód az első ember “Frisk” elnevezésével aktiválódik. Ez egy nehézségfokozó mód, amely enyhe párbeszédváltozásokból és nehezebb szörnyekkel való találkozásokból áll (némelyik kizárólag ebben a módban, míg mások a CORE-ban találhatók). A Hard Mode csak a Ruins végéig tart, hasonlóan az Undertale demóhoz. Toriel legyőzése után az Idegesítő Kutya érkezik, hogy bejelentse a Hard Mode végét.