Az evolúciós folyamat eredményeként az L. reuteri egész életében hozzájárul az emberi egészséghez. Az emberek szinte sterilen születnek, és először a szülés során és a szoptatás során találkoznak az L. reuterivel. A bélmikrobióta kulcsfontosságú tagjaként az L. reuteri fontos szerepet játszik abban, hogy a csecsemők megemésszék az anyatejet és a szilárd ételeket. A baktériumok egész életük során feszesítik a bélnyálkahártyát, hogy megakadályozzák a szivárgást és javítsák az immunválaszt. Emellett olyan molekulákat bocsátanak ki, amelyek elősegítik az egészséges és változatos mikrobióta kialakulását, és megakadályozzák a kórokozók elszaporodását. A bélmikrobióta támogatása különösen fontos az élet későbbi szakaszában, mivel az idős emberek bélrendszerének sokfélesége hajlamos csökkenni.
Néhány embernek ma is van L. reuteri a mikrobiótája részeként, de modern életmódunk következtében sok emberből hiányoznak ezek a törzsek. A rostszegény étrend, a fokozott higiénia, az antibiotikum-használat és a császármetszéssel történő szülések növekvő aránya – amelyek során a csecsemők nem kerülnek kapcsolatba a baktériummal – mind szerepet játszottak abban, hogy az L. reuteri kimerült a gyomor-bélrendszerünkből.
Az emberek probiotikumok használatával újra be tudják vezetni az L. reuterit, de ezeket gyakran kell pótolni, mivel a baktériumok folyamatosan kimosódnak a GI-traktusból.