Il Milligan College si trova nella contea di Carter nel Tennessee orientale. Le sue origini risalgono ad un Istituto maschile e femminile di Buffalo (1866) fondato da una piccola congregazione cristiana (Discepoli di Cristo). Nel 1882 Josephus Hopwood lo trasformò in un college che prende il nome da un venerato professore dell’Università del Kentucky. Hopwood, la personalità dominante nella prima storia del collegio, servì come presidente fino al 1903 e coniò il suo motto duraturo, “Educazione cristiana – la speranza del mondo”
Una nuova era iniziò nel 1917. Il nuovo presidente, Henry J. Derthick, un amato “pastore delle colline”, completò i quattro edifici principali che sopravvissero alla seconda guerra mondiale, quando il college convertì tutte le sue strutture in un programma V-12 della Marina e creò un competitivo college di arti liberali per servire i giovani delle vicine montagne. Un temporaneo boom del dopoguerra portò troppo rapidamente ad un quasi disastro. Uno scandalo nell’ufficio del presidente, importanti dimissioni della facoltà, un programma sportivo troppo costoso e un forte calo delle iscrizioni (sotto i 300) portarono alla quasi bancarotta e alla perdita dell’accreditamento regionale.
L’era moderna iniziò nei giorni bui del 1950. Dean E. Walker venne dalla Butler University come nuovo presidente. Allineò Milligan con una fazione conservatrice e indipendente (Chiese Cristiane e Chiese di Cristo) all’interno del movimento dei Discepoli. Questo aiutò a ottenere un maggiore sostegno finanziario da individui e congregazioni simpatiche. Il corpo studentesco meno regionale e in crescita (866 nel 1995-96) rappresentava sempre di più questo sodalizio. Milligan, con una crescente stabilità finanziaria e un campus molto ampliato, riacquistò l’accreditamento regionale nel 1960.
Nell’anno accademico 2000-2001, oltre 900 studenti erano iscritti a Milligan. Il college offriva ventinove major. Donald R. Jeanes, un alumno del college, divenne il quattordicesimo presidente dell’istituzione nel 1997.