Unidade política
Os esforços de Jinnah para realizar a união política dos hindus e muçulmanos valeram-lhe o título de “o melhor embaixador da unidade hindu-muçulmana”, um epíteto cunhado por Gokhale. Foi em grande parte através de seus esforços que o Partido do Congresso e a Liga Muçulmana começaram a realizar suas sessões anuais em conjunto, para facilitar a consulta e participação mútua. Em 1915, as duas organizações realizaram suas reuniões em Bombaim e em 1916 em Lucknow, onde o Pacto de Lucknow foi concluído. Nos termos do pacto, as duas organizações selaram um esquema de reforma constitucional que se tornou sua exigência conjunta para com o governo britânico. Houve muito dar e receber, mas os muçulmanos obtiveram uma importante concessão sob a forma de eleitorados separados, já concedida pelo governo em 1909, mas até então resistida pelo Congresso.
Meanwhile, uma nova força na política indiana tinha aparecido na pessoa de Mohandas (Mahatma) Gandhi. Tanto a Home Rule League como o Partido do Congresso tinham estado sob o seu domínio. Ao contrário do movimento de não-cooperação de Gandhi e sua abordagem essencialmente hindu à política, Jinnah deixou tanto a liga quanto o Partido do Congresso em 1920. Por alguns anos ele se manteve distante dos principais movimentos políticos. Ele continuou a acreditar firmemente na unidade hindu-muçulmana e nos métodos constitucionais para a realização de fins políticos. Após sua retirada do Congresso, ele usou a plataforma da Liga Muçulmana para a propagação de seus pontos de vista. Mas durante a década de 1920 a Liga Muçulmana, e com ela a Jinnah, tinha sido ofuscada pelo Congresso e pelo movimento Khilafat muçulmano de orientação religiosa.
Quando o fracasso do movimento de não-cooperação e o surgimento dos movimentos revivalistas hindus levaram a antagonismos e motins entre hindus e muçulmanos, a Liga Muçulmana começou a perder força e coesão, e os líderes muçulmanos das províncias formaram os seus próprios partidos para servir as suas necessidades. Assim, o problema de Jinnah durante os anos seguintes foi converter a Liga Muçulmana em um órgão político iluminado e unificado preparado para cooperar com outras organizações que trabalham pelo bem da Índia. Além disso, ele teve que convencer o Partido do Congresso, como pré-requisito para o progresso político, da necessidade de resolver o conflito hindu-muçulmano.
Para conseguir tal aproximação foi o principal propósito de Jinnah durante o final dos anos 20 e início dos anos 30. Ele trabalhou para esse fim na assembleia legislativa, na Conferência da Mesa Redonda em Londres (1930-32), e através dos seus “14 pontos”, que incluíram propostas para uma forma federal de governo, maiores direitos para as minorias, um terço de representação dos muçulmanos na legislatura central, separação da região predominantemente muçulmana Sindh do resto da província de Bombaim, e introdução de reformas na Província da Fronteira Noroeste. A sua incapacidade de introduzir alterações menores nas propostas da Comissão Nehru (1928) sobre a questão da separação dos eleitorados e da reserva de lugares para os muçulmanos nas legislaturas frustrou-o. Ele encontrava-se numa posição peculiar naquela época: muitos muçulmanos pensavam que ele era demasiado nacionalista na sua política e que os interesses muçulmanos não estavam seguros nas suas mãos, enquanto que o Partido do Congresso não iria sequer satisfazer a meio caminho as exigências muçulmanas moderadas. Na verdade, a Liga Muçulmana era uma casa dividida contra si mesma. A Liga Muçulmana do Punjab repudiou a liderança de Jinnah e se organizou separadamente. Com repugnância, a Jinnah decidiu estabelecer-se na Inglaterra. De 1930 a 1935, ele permaneceu em Londres, dedicando-se à prática perante o Conselho Privado. Mas quando as mudanças constitucionais estavam para acontecer, ele foi persuadido a voltar para casa para liderar uma Liga Muçulmana reconstituída.
Em breve começaram os preparativos para as eleições sob a Lei do Governo da Índia de 1935. Jinnah ainda estava pensando em termos de cooperação entre a Liga Muçulmana e o Partido do Congresso, controlado pelos hindus, e com os governos de coalizão nas províncias. Mas as eleições de 1937 provaram ser um ponto de viragem nas relações entre as duas organizações. O Congresso obteve maioria absoluta em seis províncias, e a liga não se saiu particularmente bem. O Partido do Congresso decidiu não incluir a liga na formação dos governos provinciais, e o resultado foi a exclusividade de todos os governos do Congresso. As relações entre hindus e muçulmanos começaram a deteriorar-se, e logo o descontentamento muçulmano tornou-se sem limites.