O papel da fotofosforilação cíclica na assimilação de CO2 fotossintético foi investigado em cloroplastos isolados e intactos, capazes de altas taxas de fixação de CO2. O ATP produzido pela fotofosforilação cíclica endógena desempenhou um papel importante na redução do período de defasagem na assimilação de CO2 e na formação de fosfatos de açúcar. A inibição da fotofosforilação cíclica ou não cíclica reduziu severamente a fixação total de CO2, mas deu padrões contrastantes de produtos formados: aumentou os fosfatos de açúcar e diminuiu o fosfoglicérato quando a fotofosforilação não cíclica foi inibida e diminuiu os fosfatos de açúcar e aumentou o fosfoglicérato quando a fotofosforilação cíclica foi inibida. Antimicina A, que inibe a fotofosforilação cíclica catalisada por ferredoxina em cloroplastos quebrados, também foi encontrada para inibir a fotofosforilação cíclica endógena em cloroplastos intactos, com a consequente diminuição da assimilação total de CO2 e a mudança característica para o aumento do fosfoglicerato e diminuição da formação de fosfato de açúcar. A adição de ATP aos cloroplastos inibidos pela antimicina A quadruplicou a taxa de fixação de CO2 e restaurou os produtos ao seu padrão original. Estes resultados suportam a visão de que o ATP produzido pela fotofosforilação cíclica é essencial para manter uma alta taxa de assimilação de CO2 e manter uma alta relação ATP:NADPH que favorece a conversão do fosfoglicérato em carboidrato.