Rolul fotofosforilării ciclice în asimilarea fotosintetică a CO2 a fost investigat în cloroplaste izolate, intacte, capabile de rate mari de fixare a CO2. S-a constatat că ATP produs de fotofosforilarea ciclică endogenă joacă un rol important în scurtarea perioadei de întârziere în asimilarea CO2 și în formarea fosfaților de zahăr. Inhibarea fie a fotofosforilării ciclice, fie a celei neciclice, a redus drastic fixarea totală a CO2, dar a dat naștere unor modele contrastante de produse formate: creșterea fosfaților de zahăr și scăderea fosfogliceratului atunci când a fost inhibată fotofosforilarea neciclică și scăderea fosfaților de zahăr și creșterea fosfogliceratului atunci când a fost inhibată fotofosforilarea ciclică. S-a constatat că antimicina A, care inhibă fotofosforilarea ciclică catalizată de ferredoxină în cloroplastele rupte, inhibă, de asemenea, fotofosforilarea ciclică endogenă în cloroplastele intacte, ceea ce duce la o scădere a asimilării totale de CO2 și la o schimbare caracteristică spre creșterea fosfogliceratului și scăderea formării de fosfați de zahăr. Adăugarea de ATP la cloroplastele inhibate de antimicina A a cvadruplat rata de fixare a CO2 și a readus produsele la modelul lor inițial. Aceste rezultate susțin punctul de vedere conform căruia ATP-ul produs de fotofosforilarea ciclică este esențial pentru susținerea unei rate ridicate de asimilare a CO2 și pentru menținerea unui raport ATP:NADPH ridicat care favorizează conversia fosfogliceratului în carbohidrați.
.