Epitop, även kallad antigendeterminant, del av ett främmande protein, eller antigen, som kan stimulera ett immunsvar. En epitop är den del av antigenet som binder till en specifik antigenreceptor på ytan av en B-cell. Bindning mellan receptorn och epitopen sker endast om deras strukturer är komplementära. Om de är det passar epitop och receptor ihop som två pusselbitar, en händelse som är nödvändig för att aktivera B-cellernas produktion av antikroppar. De antikroppar som produceras av B-celler är specifikt inriktade på de epitoper som binder till cellernas antigenreceptorer. Epitopen är alltså också det område av antigenet som känns igen av specifika antikroppar, som binder till och avlägsnar antigenet från kroppen.
Många antigener har en mängd olika distinkta epitoper på sina ytor. Varje epitop kan reagera med en annan B-cells antigenreceptor. Dessutom innehåller blodserumet från en immuniserad person eller ett immuniserat djur normalt en blandning av antikroppar som alla kan kombinera med samma antigen men med olika epitoper som förekommer på antigenets yta. Dessutom har antikroppar som binder till samma epitop ofta olika förmåga att binda till den epitopen.
Det är möjligt att två eller flera olika antigener har en epitop gemensamt. I dessa fall kan antikroppar som är riktade mot ett antigen reagera med alla andra antigener som bär på samma epitop. Sådana antigener kallas korsreagerande antigener.