Jemison lämnade NASA i mars 1993. Hon fortsatte att undervisa vid Dartmouth College. Hon grundade också sitt eget företag, Jemison Group, som syftar till att uppmuntra en kärlek till vetenskap hos elever och föra ut avancerad teknik till skolor runt om i världen. Hon är en stark förespråkare för vetenskap och inrättade ett internationellt vetenskapsläger för gymnasieelever.
Hon har också tagit över ledningen av 100-Year Starship-programmet som inrättats av DARPA, Defense Advanced Research Projects Agency. Projektet arbetar för att göra mänskliga rymdresor bortom solsystemet till en realitet inom nästa århundrade – men på ett sätt som inkluderar och gynnar så många människor på jorden som möjligt.
Citat från Mae Jemison
”Det jag har gjort under hela mitt liv är att göra det bästa jobbet jag kan och att vara mig själv”. – Ebony Magazine, oktober 1987
”Låt dig aldrig begränsas av andra människors begränsade fantasi… Om du antar deras attityder kommer möjligheten inte att existera eftersom du redan har stängt den ute…. Du kan höra andras visdom, men du måste omvärdera världen själv.” – Vid den årliga konferensen om biomedicinsk forskning för minoritetsstudenter, november 2009