Kristendomen introducerades i Etiopien på 400-talet, och den etiopiska ortodoxa kyrkan (kallad Tewahdo i Etiopien) är en av de äldsta organiserade kristna organisationerna i världen. Kyrkan har länge haft en dominerande roll i Etiopiens kultur och politik och har fungerat som den styrande elitens officiella religion fram till monarkins fall 1974. Den har också fungerat som förvaringsplats för Etiopiens litterära tradition och bildkonst. Kristendomens kärnområde ligger på höglandet i norra Etiopien, men dess inflytande märks i hela landet. Mer än två femtedelar av etiopierna följer den etiopisk-ortodoxa kyrkans läror. Ytterligare en femtedel ansluter sig till andra kristna trosriktningar, varav de allra flesta är protestantiska.
Islam infördes på 700-talet och praktiseras nu av ungefär en tredjedel av etiopierna. Den är viktigast i de avlägsna regionerna, särskilt på det östra låglandet, men det finns lokala koncentrationer i hela landet. Traditionellt sett har islams status varit långt ifrån likvärdig med kristendomens. Haile Selassie I (som regerade 1930-74) gav dock audienser till muslimska ledare och gjorde närmanden för att bemöta deras oro, och under Derg-regimen (1974-91) gjordes ännu mer för att ge de två religionerna åtminstone symbolisk jämlikhet. Trots detta har uppfattningen om Etiopien som ”en kristendomens ö i ett islams hav” fortsatt att råda både bland etiopier från höglandet och bland utlänningar. Det finns en viss oro bland höglandsborna att fundamentalistiska muslimska rörelser i regionen och i grannländerna kan väcka känslor för en större roll för islam i Etiopien.
En liten del av etiopierna är animister som dyrkar en mängd olika afrikanska gudar. Majoriteten av dessa traditionalister talar nilotiska språk, till exempel Kunama, och befinner sig på västra låglandet.
Judaism har länge utövats i närheten av den gamla staden Gonder. De flesta av de etiopiska judarna – som kallar sig själva Beta Israel – har flyttat till Israel (se Researcher’s Note: Beta Israel migration to Israel, 1980-92).