Úloha cyklické fotofosforylace při fotosyntetické asimilaci CO2 byla zkoumána u izolovaných neporušených chloroplastů schopných vysoké rychlosti fixace CO2. Bylo zjištěno, že ATP produkovaný endogenní cyklickou fotofosforylací hraje důležitou roli při zkracování doby zpoždění asimilace CO2 a při tvorbě cukerných fosfátů. Inhibice cyklické nebo necyklické fotofosforylace výrazně snížila celkovou fixaci CO2, ale poskytla kontrastní vzorce vytvářených produktů: zvýšení cukerných fosfátů a snížení fosfoglycerátu při inhibici necyklické fotofosforylace a snížení cukerných fosfátů a zvýšení fosfoglycerátu při inhibici cyklické fotofosforylace. Bylo zjištěno, že antimycin A, který inhibuje ferredoxinem katalyzovanou cyklickou fotofosforylaci v porušených chloroplastech, inhibuje také endogenní cyklickou fotofosforylaci v neporušených chloroplastech, což má za následek snížení celkové asimilace CO2 a charakteristický posun ke zvýšené tvorbě fosfoglycerátu a snížené tvorbě cukerného fosfátu. Přidání ATP do chloroplastů inhibovaných antimycinem A čtyřnásobně zvýšilo rychlost fixace CO2 a obnovilo původní průběh produktů. Tyto výsledky podporují názor, že ATP vznikající cyklickou fotofosforylací je nezbytný pro udržení vysoké rychlosti asimilace CO2 a udržení vysokého poměru ATP:NADPH, který podporuje přeměnu fosfoglycerátu na sacharid.