このソフトウェアは、3Dモデルを仮想空間に取り込み、それに応じて動かし、アニメーションさせることができるものです。 3Dフィギュアの位置関係を簡単に変更したり、表情を変えたり（モーフが使えるモデルであれば）、モーションデータを適用して動かしたりすることが可能です。 また、MME（MikuMikuEffect）プラグインがインストールされていれば、レンズフレアやオートルミナス（発光・光らせる効果）などのエフェクトを適用することができます。 また、サウンドや音楽を追加して、ミュージックビデオやショートフィルム、ファンメイドストーリーを作成することも可能です。 キャラクターのアニメーションに使用するモーションデータは.vmd（Vocaloid Motion Data）ファイル、スクリーンショットの作成に主に使用するポーズデータは.vpd（Vocaloid Pose Data）ファイルとして書き出すことができる。 エクスポートしたファイルは、そのファイル形式を使用できるソフトウェアで作成した他のプロジェクトにインポートすることができます。 これにより、他のユーザーとデータを共有することができます。 また、物理エンジンには「Bullet」を採用しています。 また、Microsoft社のKinectを利用したモーションキャプチャも可能です。
ダウンロード時に付属する一部のモデル、ステージ、モーションデータ、アクセサリを除き、3D モデルを含むすべてのコンテンツはユーザーによって配布されるため、すべてのルールと制限はケースによって大きく異なります。 ほとんどのモデルのルールは、Readmeファイル（.txt、pdf、またはウェブページファイル）に記載されています。 作者であるHiguchiMは、他のユーザーのファンモデルの使用可否について、いかなる約束もできないと述べており、この件に関するすべての責任を免除されます。 他のユーザーが作成したモデルは、一般にダウンロード可能であることが多い。 MikuMikuDanceはポージングとアニメーション専用のソフトウェアであるため、モデラーはBlenderやMetasequoiaなどの3DモデリングソフトウェアでモデルとUVマップを作成し、MMDプラットフォームへの変換（顔のモーフ、骨、肉体など）はMMDモデル変換専用のプログラム、PMD Editorまたはその後継のPMX editorで行われます。
ソフトウェア自体には、有名なボーカロイドの少数のモデルと、MME で粒子効果を付けることができる不可視のグリッド、ステージ、いくつかのアクセサリー、および MMD プロジェクトを保存するファイル形式である .pmm ファイルの形で MMD でできることのサンプルが付属しています。 当初は日本語版のみでしたが、後日英語版もリリースされました。 ニコニコ動画やYouTubeなどで動画が公開され、ボーカロイドファンやユーザーから人気を博している。 また、その人気から毎号限定モデルを配布する雑誌も制作された。 ボーカロイド用のモデルの中には、ボーカロイドの楽曲に使用されるものもあり、ボーカロイドソフトを使用しているスタジオで使用されることもあります。
また、Windows100の雑誌を購入する人も多いと思いますが、その雑誌には一般向けのモデルが掲載されており、人気があるため、モデルクリエイターがお金を払って購入したモデルだけでなく、シークレットモデルを配布していることもあります。
2011年5月26日、継続的なアップデートが終了し、最終バージョンがリリースされた。
2011年5月26日に継続的なアップデートを終了し、最終版をリリース。 しかし、ソースコードは公開されておらず、開発者にもその意志はないため、オリジナルのソフトを基にした開発を続けることは不可能です。 しかし、MikuMikuMoving（頻繁に更新され、MMDの多くの機能に加えて、このプログラム独自の新しいファイル形式、Oculus Riftヘッドマウントディスプレイのサポート、新しいUIなどを備えたMMDの「代替」プログラム）や、フリーソフトウェアのBlenderなど、同様の機能を提供する代替プログラムが存在します。
当時から現在までの間に、MMD バージョン 7.39 にはいくつかの追加機能がありましたが、主に、通常版よりも動作が良く、32 ビットコンピューターにはない 64 ビットコンピューターのパワーを利用するための x64 版が追加されています。 しかし、2013年6月1日、MikuMikuDanceの作者が突然、プログラムのアップデートを公開し始めました。 彼が再びアップデートをリリースし始めた後、20の新しいバージョンとその64ビット版があります。 6月1日以前の最新バージョンは、2011年5月26日にリリースされた7.39です。 MMD ver. 7.39は、初公開からver.7.39になるまでに何度かプログラムアップデートが行われました。 7.39mがリリースされるまでの間に、いくつかのプログラムアップデートが行われました。 これらのアップデートのほとんどは、より新しい、より高度な.pmxモデルとの互換性を高めるために行われたに過ぎません。 制作者が再び編集を開始した理由は不明です。 2019年12月10日、最新版となるver9.32がリリースされた
2014年12月、セカイプロジェクトはSteamでのMikuMikuDanceのリリース許可を取得したことを発表した。
本ソフトウェアで初めて本格的に制作されたテレビアニメシリーズ『直球表題作ロボットアニメ』が2013年2月5日に初放送された
本ソフトウェアを使用したテレビアニメシリーズ『直球表題作ロボットアニメ』は、2013年2月5日に初放送された。