När de är korsfosforylerade fungerar RTK:s cytoplasmatiska svansar som dockningsplattformar för olika intracellulära proteiner som deltar i signaltransduktionen. Dessa proteiner har en särskild domän – kallad SH2 – som binder till fosforylerade tyrosiner i de cytoplasmatiska RTK-receptorstjärtarna. Mer än ett SH2-innehållande protein kan binda samtidigt till en aktiverad RTK, vilket möjliggör samtidig aktivering av flera intracellulära signalvägar. I slutändan leder RTK-aktivering till förändringar i genernas transkription. Signalering blir komplex när signalerna färdas från membranen till kärnan, på grund av överlappning mellan intermediärer i olika signalvägar i cellen (figur 1).
One of the most common intracellular signaling pathways triggered by RTKs is known as the mitogen-activated protein (MAP) kinase cascade, because it involves three serine-threonine kinases. Vägarna börjar med aktivering av Ras, ett litet G-protein som är förankrat i plasmamembranet. I sitt inaktiva tillstånd är Ras bundet till GDP. Men när SH2-innehållande proteiner förenar sig med aktiverade RTK:er får de Ras att binda GTP i stället för GDP och blir aktivt. Därefter aktiverar det GTP-bundna Ras (som i sig självt inte är ett kinas) det första serintreoninkinaset i MAP-kinasekaskaden. Var och en av de tre kinaserna i denna kaskad aktiverar sedan nästa genom att fosforylera det. Eftersom alla tre kinaser i denna väg fosforylerar flera substrat förstärks den ursprungliga signalen i varje steg. Det sista enzymet i vägen fosforylerar sedan transkriptionsregulatorer, vilket leder till en förändring i genernas transkription (figur 2). Många tillväxtfaktorer, bland annat nervtillväxtfaktor och platelet-derived growth factor, använder denna väg.
Inte alla RTK:er använder MAP-kinas-kaskaden för att skicka information till kärnan. Till exempel aktiverar receptorer för insulinliknande tillväxtfaktorer enzymet fosfoinositid 3-kinas, som fosforylerar inositolfosfolipider i cellmembranet, vilket i sin tur leder till en proteinkinasekaskad (som skiljer sig från MAP-kinasekaskaden) som vidarebefordrar signalen till kärnan. Andra RTK:er använder en mer direkt väg till kärnan. Transkriptionsregulatorer som kallas STAT-proteiner, en akronym för signal transducers and activators of transcription, binder till de fosforylerade tyrosinerna i receptorerna för cytokiner och vissa hormoner. När STAT-proteinerna väl är aktiverade rör de sig direkt in i kärnan och orsakar förändringar i transkriptionen.