Při propuknutí genitálního herpesu lze virus kultivovat asi 11 dní při prvním propuknutí a asi 4 dny při recidivě. Virus však může být na kůži nalezen i v období mezi propuknutím epidemie.
Jak se ukázalo, herpes virus se stává aktivním a může být „vylučován“ z kůže i ve dnech, kdy se pacienti, u nichž se genitální HSV-2 opakuje, cítí naprosto dobře, a u lidí, kteří mají pouze pozitivní krevní test na HSV-2 a nikdy u nich nedošlo k propuknutí nemoci. V klíčové studii byly ženám se symptomatickým genitálním herpesem typu 2 odebírány kultury z děložního čípku, vulvy a konečníku každý den po dobu více než 3 měsíců. Své příznaky sledovaly také pomocí denního deníku.
U žen s genitálním herpesem HSV-2 se ve 2 % dnů objevilo vylučování bez příznaků. Častěji vylučovaly v 7 dnech před vypuknutím nebo po něm. Vylučování trvalo méně dní, kdy byly bez propuknutí nemoci, ale stále představovalo jednu třetinu všech dní, kdy virus vylučovaly.
A co 80 % lidí, kteří jsou HSV-2 pozitivní a kteří o své infekci nevědí? Vzorky od pacientů, kteří měli herpes typu 2, ale nikdy neměli příznaky, byly porovnány s pacienty s genitálním HSV-2, kteří měli příznaky, pokud jde o vylučování herpes viru. Pacienti, kteří měli v anamnéze příznaky, vylučovali virus, i když neměli žádné příznaky, ve 13 % dnů, zatímco pacienti, kteří měli HSV-2 pouze na základě krevních testů, vylučovali virus v 9 % dnů. Zajímavé je, že množství vylučovaného viru v době, kdy nebyly přítomny žádné příznaky, bylo v obou skupinách v podstatě stejné.
Přesná míra vylučování genitálního viru HSV-1 v době mezi propuknutím nemoci není známa, ale předpokládá se, že je mnohem nižší než u genitálního oparu HSV-2. Jedna malá studie využívající kultivace, a nikoli mnohem citlivější test PCR, zjistila vylučování pouze v 1 z každých 200 dnů. Bohužel víme, že HSV-1 se vylučuje také asymptomaticky z úst a ve vyspělých zemích, jako jsou USA, je zodpovědný za většinu nových infekcí genitálního oparu.
Některé věci jsou spojeny s rizikem vylučování a některé ne. U genitálního oparu to nebyla doba měsíce ve vztahu k menstruaci, sexuální orientaci a sexu. Mít v anamnéze předchozí výsevy, zejména více než 8 výsevů/rok, a být bělochem jsou rizikem pro zvýšení asymptomatického genitálního vylučování, stejně jako pro zvýšení celkového vylučování (symptomatické a asymptomatické vylučování dohromady).
Podstatné je, že lidé mohou virus vylučovat mezi propuknutím nemoci, když se cítí dobře, a lidé, kteří nikdy nemají příznaky, mohou virus také vylučovat.